Protein–RNA interactions for Protein: P20020

ATP2B1, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2B1P20020 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATP2B1P20020 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATP2B1P20020 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATP2B1P20020 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATP2B1P20020 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATP2B1P20020 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATP2B1P20020 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
ATP2B1P20020 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATP2B1P20020 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATP2B1P20020 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATP2B1P20020 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATP2B1P20020 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATP2B1P20020 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATP2B1P20020 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
ATP2B1P20020 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
ATP2B1P20020 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
ATP2B1P20020 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
ATP2B1P20020 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATP2B1P20020 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATP2B1P20020 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATP2B1P20020 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATP2B1P20020 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATP2B1P20020 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATP2B1P20020 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATP2B1P20020 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATP2B1P20020 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATP2B1P20020 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATP2B1P20020 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATP2B1P20020 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATP2B1P20020 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATP2B1P20020 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATP2B1P20020 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATP2B1P20020 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATP2B1P20020 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
ATP2B1P20020 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATP2B1P20020 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATP2B1P20020 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATP2B1P20020 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATP2B1P20020 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATP2B1P20020 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATP2B1P20020 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATP2B1P20020 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATP2B1P20020 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATP2B1P20020 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATP2B1P20020 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATP2B1P20020 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATP2B1P20020 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATP2B1P20020 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATP2B1P20020 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATP2B1P20020 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATP2B1P20020 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATP2B1P20020 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATP2B1P20020 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATP2B1P20020 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATP2B1P20020 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATP2B1P20020 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATP2B1P20020 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATP2B1P20020 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATP2B1P20020 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATP2B1P20020 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATP2B1P20020 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATP2B1P20020 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
ATP2B1P20020 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATP2B1P20020 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATP2B1P20020 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATP2B1P20020 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATP2B1P20020 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATP2B1P20020 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATP2B1P20020 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATP2B1P20020 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATP2B1P20020 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATP2B1P20020 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATP2B1P20020 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATP2B1P20020 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATP2B1P20020 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATP2B1P20020 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATP2B1P20020 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATP2B1P20020 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATP2B1P20020 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATP2B1P20020 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATP2B1P20020 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATP2B1P20020 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATP2B1P20020 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATP2B1P20020 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATP2B1P20020 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATP2B1P20020 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATP2B1P20020 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATP2B1P20020 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATP2B1P20020 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
ATP2B1P20020 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATP2B1P20020 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATP2B1P20020 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ATP2B1P20020 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
ATP2B1P20020 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ATP2B1P20020 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
ATP2B1P20020 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
ATP2B1P20020 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ATP2B1P20020 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ATP2B1P20020 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ATP2B1P20020 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms