Protein–RNA interactions for Protein: P19256

CD58, Lymphocyte function-associated antigen 3, humanhuman

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD58P19256 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CD58P19256 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CD58P19256 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CD58P19256 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CD58P19256 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CD58P19256 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CD58P19256 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CD58P19256 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CD58P19256 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CD58P19256 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CD58P19256 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CD58P19256 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CD58P19256 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CD58P19256 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CD58P19256 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CD58P19256 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CD58P19256 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CD58P19256 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CD58P19256 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CD58P19256 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CD58P19256 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CD58P19256 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CD58P19256 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CD58P19256 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CD58P19256 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CD58P19256 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CD58P19256 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CD58P19256 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CD58P19256 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CD58P19256 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CD58P19256 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CD58P19256 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CD58P19256 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CD58P19256 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CD58P19256 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CD58P19256 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CD58P19256 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CD58P19256 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CD58P19256 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CD58P19256 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CD58P19256 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CD58P19256 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CD58P19256 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CD58P19256 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CD58P19256 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CD58P19256 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CD58P19256 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CD58P19256 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CD58P19256 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CD58P19256 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CD58P19256 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CD58P19256 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CD58P19256 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CD58P19256 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CD58P19256 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CD58P19256 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CD58P19256 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CD58P19256 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CD58P19256 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CD58P19256 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CD58P19256 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CD58P19256 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CD58P19256 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CD58P19256 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CD58P19256 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CD58P19256 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CD58P19256 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CD58P19256 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CD58P19256 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CD58P19256 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CD58P19256 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CD58P19256 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CD58P19256 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CD58P19256 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CD58P19256 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CD58P19256 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CD58P19256 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CD58P19256 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CD58P19256 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CD58P19256 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CD58P19256 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CD58P19256 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CD58P19256 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CD58P19256 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CD58P19256 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CD58P19256 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CD58P19256 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CD58P19256 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CD58P19256 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CD58P19256 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CD58P19256 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CD58P19256 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CD58P19256 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CD58P19256 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CD58P19256 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CD58P19256 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CD58P19256 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CD58P19256 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CD58P19256 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CD58P19256 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms