Protein–RNA interactions for Protein: P18564

ITGB6, Integrin beta-6, humanhuman

Predictions only

Length 788 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB6P18564 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ITGB6P18564 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ITGB6P18564 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ITGB6P18564 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ITGB6P18564 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ITGB6P18564 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ITGB6P18564 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ITGB6P18564 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ITGB6P18564 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.87
ITGB6P18564 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
ITGB6P18564 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ITGB6P18564 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ITGB6P18564 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ITGB6P18564 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ITGB6P18564 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ITGB6P18564 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ITGB6P18564 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ITGB6P18564 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ITGB6P18564 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ITGB6P18564 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
ITGB6P18564 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ITGB6P18564 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ITGB6P18564 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ITGB6P18564 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ITGB6P18564 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ITGB6P18564 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ITGB6P18564 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ITGB6P18564 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ITGB6P18564 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ITGB6P18564 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ITGB6P18564 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ITGB6P18564 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ITGB6P18564 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ITGB6P18564 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ITGB6P18564 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ITGB6P18564 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ITGB6P18564 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ITGB6P18564 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ITGB6P18564 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ITGB6P18564 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ITGB6P18564 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ITGB6P18564 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ITGB6P18564 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ITGB6P18564 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ITGB6P18564 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ITGB6P18564 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ITGB6P18564 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ITGB6P18564 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ITGB6P18564 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ITGB6P18564 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ITGB6P18564 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ITGB6P18564 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ITGB6P18564 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ITGB6P18564 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
ITGB6P18564 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ITGB6P18564 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
ITGB6P18564 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
ITGB6P18564 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ITGB6P18564 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ITGB6P18564 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ITGB6P18564 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ITGB6P18564 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ITGB6P18564 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ITGB6P18564 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ITGB6P18564 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ITGB6P18564 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ITGB6P18564 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ITGB6P18564 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ITGB6P18564 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ITGB6P18564 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ITGB6P18564 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ITGB6P18564 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
ITGB6P18564 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ITGB6P18564 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ITGB6P18564 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ITGB6P18564 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ITGB6P18564 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ITGB6P18564 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ITGB6P18564 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ITGB6P18564 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ITGB6P18564 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
ITGB6P18564 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ITGB6P18564 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ITGB6P18564 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ITGB6P18564 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ITGB6P18564 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ITGB6P18564 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
ITGB6P18564 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ITGB6P18564 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ITGB6P18564 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ITGB6P18564 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ITGB6P18564 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ITGB6P18564 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ITGB6P18564 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ITGB6P18564 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ITGB6P18564 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ITGB6P18564 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ITGB6P18564 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ITGB6P18564 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ITGB6P18564 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms