Protein–RNA interactions for Protein: P17987

TCP1, T-complex protein 1 subunit alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCP1P17987 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TCP1P17987 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TCP1P17987 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TCP1P17987 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TCP1P17987 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TCP1P17987 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TCP1P17987 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TCP1P17987 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TCP1P17987 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TCP1P17987 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
TCP1P17987 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TCP1P17987 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TCP1P17987 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TCP1P17987 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
TCP1P17987 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TCP1P17987 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TCP1P17987 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TCP1P17987 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TCP1P17987 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TCP1P17987 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TCP1P17987 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TCP1P17987 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TCP1P17987 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TCP1P17987 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TCP1P17987 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TCP1P17987 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TCP1P17987 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TCP1P17987 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TCP1P17987 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TCP1P17987 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TCP1P17987 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TCP1P17987 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TCP1P17987 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TCP1P17987 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
TCP1P17987 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TCP1P17987 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TCP1P17987 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TCP1P17987 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TCP1P17987 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TCP1P17987 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
TCP1P17987 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TCP1P17987 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TCP1P17987 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TCP1P17987 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TCP1P17987 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TCP1P17987 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TCP1P17987 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TCP1P17987 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TCP1P17987 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TCP1P17987 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TCP1P17987 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TCP1P17987 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TCP1P17987 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TCP1P17987 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TCP1P17987 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TCP1P17987 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TCP1P17987 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TCP1P17987 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TCP1P17987 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TCP1P17987 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TCP1P17987 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TCP1P17987 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TCP1P17987 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TCP1P17987 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TCP1P17987 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
TCP1P17987 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TCP1P17987 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TCP1P17987 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TCP1P17987 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TCP1P17987 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TCP1P17987 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TCP1P17987 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TCP1P17987 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TCP1P17987 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TCP1P17987 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TCP1P17987 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TCP1P17987 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TCP1P17987 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TCP1P17987 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TCP1P17987 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TCP1P17987 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TCP1P17987 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TCP1P17987 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TCP1P17987 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TCP1P17987 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TCP1P17987 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TCP1P17987 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TCP1P17987 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TCP1P17987 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
TCP1P17987 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TCP1P17987 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TCP1P17987 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TCP1P17987 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
TCP1P17987 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
TCP1P17987 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
TCP1P17987 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
TCP1P17987 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
TCP1P17987 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TCP1P17987 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TCP1P17987 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms