Protein–RNA interactions for Protein: P17480

UBTF, Nucleolar transcription factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 764 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBTFP17480 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
UBTFP17480 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC33.43■■■□□ 2.94
UBTFP17480 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC33.43■■■□□ 2.94
UBTFP17480 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
UBTFP17480 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
UBTFP17480 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
UBTFP17480 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
UBTFP17480 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
UBTFP17480 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC33.43■■■□□ 2.94
UBTFP17480 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.43■■■□□ 2.94
UBTFP17480 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC33.43■■■□□ 2.94
UBTFP17480 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.43■■■□□ 2.94
UBTFP17480 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
UBTFP17480 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
UBTFP17480 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
UBTFP17480 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
UBTFP17480 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC33.43■■■□□ 2.94
UBTFP17480 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
UBTFP17480 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.42■■■□□ 2.94
UBTFP17480 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
UBTFP17480 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
UBTFP17480 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC33.42■■■□□ 2.94
UBTFP17480 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
UBTFP17480 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC33.42■■■□□ 2.94
UBTFP17480 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC33.42■■■□□ 2.94
UBTFP17480 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
UBTFP17480 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
UBTFP17480 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC33.42■■■□□ 2.94
UBTFP17480 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.42■■■□□ 2.94
UBTFP17480 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.41■■■□□ 2.94
UBTFP17480 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC33.41■■■□□ 2.94
UBTFP17480 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
UBTFP17480 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.41■■■□□ 2.94
UBTFP17480 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
UBTFP17480 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
UBTFP17480 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC33.41■■■□□ 2.94
UBTFP17480 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC33.41■■■□□ 2.94
UBTFP17480 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC33.41■■■□□ 2.94
UBTFP17480 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
UBTFP17480 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
UBTFP17480 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.41■■■□□ 2.94
UBTFP17480 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
UBTFP17480 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC33.4■■■□□ 2.94
UBTFP17480 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.4■■■□□ 2.94
UBTFP17480 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
UBTFP17480 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
UBTFP17480 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
UBTFP17480 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.4■■■□□ 2.94
UBTFP17480 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
UBTFP17480 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
UBTFP17480 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC33.39■■■□□ 2.94
UBTFP17480 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
UBTFP17480 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.94
UBTFP17480 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC33.39■■■□□ 2.94
UBTFP17480 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
UBTFP17480 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
UBTFP17480 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.39■■■□□ 2.94
UBTFP17480 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.93
UBTFP17480 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.38■■■□□ 2.93
UBTFP17480 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC33.38■■■□□ 2.93
UBTFP17480 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
UBTFP17480 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
UBTFP17480 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC33.38■■■□□ 2.93
UBTFP17480 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
UBTFP17480 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
UBTFP17480 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
UBTFP17480 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC33.38■■■□□ 2.93
UBTFP17480 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
UBTFP17480 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC33.38■■■□□ 2.93
UBTFP17480 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.37■■■□□ 2.93
UBTFP17480 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC33.37■■■□□ 2.93
UBTFP17480 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.37■■■□□ 2.93
UBTFP17480 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
UBTFP17480 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC33.37■■■□□ 2.93
UBTFP17480 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.37■■■□□ 2.93
UBTFP17480 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC33.37■■■□□ 2.93
UBTFP17480 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC33.37■■■□□ 2.93
UBTFP17480 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.37■■■□□ 2.93
UBTFP17480 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
UBTFP17480 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.36■■■□□ 2.93
UBTFP17480 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
UBTFP17480 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.36■■■□□ 2.93
UBTFP17480 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC33.36■■■□□ 2.93
UBTFP17480 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
UBTFP17480 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
UBTFP17480 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.36■■■□□ 2.93
UBTFP17480 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.36■■■□□ 2.93
UBTFP17480 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
UBTFP17480 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
UBTFP17480 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC33.36■■■□□ 2.93
UBTFP17480 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
UBTFP17480 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
UBTFP17480 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
UBTFP17480 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
UBTFP17480 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC33.35■■■□□ 2.93
UBTFP17480 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC33.35■■■□□ 2.93
UBTFP17480 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC33.35■■■□□ 2.93
UBTFP17480 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC33.35■■■□□ 2.93
UBTFP17480 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC33.35■■■□□ 2.93
UBTFP17480 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC33.35■■■□□ 2.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms