Protein–RNA interactions for Protein: P13646

KRT13, Keratin, type I cytoskeletal 13, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT13P13646 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KRT13P13646 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KRT13P13646 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KRT13P13646 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KRT13P13646 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KRT13P13646 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KRT13P13646 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KRT13P13646 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KRT13P13646 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KRT13P13646 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KRT13P13646 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KRT13P13646 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KRT13P13646 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KRT13P13646 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
KRT13P13646 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KRT13P13646 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KRT13P13646 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KRT13P13646 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KRT13P13646 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KRT13P13646 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KRT13P13646 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KRT13P13646 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KRT13P13646 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KRT13P13646 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KRT13P13646 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KRT13P13646 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KRT13P13646 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KRT13P13646 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KRT13P13646 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KRT13P13646 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KRT13P13646 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KRT13P13646 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KRT13P13646 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KRT13P13646 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KRT13P13646 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KRT13P13646 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KRT13P13646 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KRT13P13646 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KRT13P13646 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
KRT13P13646 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KRT13P13646 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KRT13P13646 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KRT13P13646 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KRT13P13646 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KRT13P13646 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KRT13P13646 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KRT13P13646 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KRT13P13646 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KRT13P13646 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KRT13P13646 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KRT13P13646 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KRT13P13646 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KRT13P13646 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KRT13P13646 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KRT13P13646 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KRT13P13646 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KRT13P13646 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KRT13P13646 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KRT13P13646 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KRT13P13646 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KRT13P13646 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KRT13P13646 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KRT13P13646 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KRT13P13646 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KRT13P13646 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KRT13P13646 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KRT13P13646 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KRT13P13646 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KRT13P13646 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KRT13P13646 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KRT13P13646 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KRT13P13646 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KRT13P13646 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KRT13P13646 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KRT13P13646 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KRT13P13646 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KRT13P13646 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KRT13P13646 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KRT13P13646 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KRT13P13646 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
KRT13P13646 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KRT13P13646 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KRT13P13646 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KRT13P13646 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KRT13P13646 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KRT13P13646 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KRT13P13646 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KRT13P13646 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KRT13P13646 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KRT13P13646 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KRT13P13646 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KRT13P13646 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KRT13P13646 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KRT13P13646 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KRT13P13646 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KRT13P13646 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KRT13P13646 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KRT13P13646 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KRT13P13646 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KRT13P13646 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms