Protein–RNA interactions for Protein: P12838

DEFA4, Neutrophil defensin 4, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA4P12838 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DEFA4P12838 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DEFA4P12838 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DEFA4P12838 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DEFA4P12838 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DEFA4P12838 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DEFA4P12838 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DEFA4P12838 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
DEFA4P12838 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DEFA4P12838 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DEFA4P12838 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DEFA4P12838 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DEFA4P12838 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DEFA4P12838 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
DEFA4P12838 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DEFA4P12838 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DEFA4P12838 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DEFA4P12838 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DEFA4P12838 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DEFA4P12838 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DEFA4P12838 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DEFA4P12838 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DEFA4P12838 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DEFA4P12838 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DEFA4P12838 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DEFA4P12838 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DEFA4P12838 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DEFA4P12838 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DEFA4P12838 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DEFA4P12838 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DEFA4P12838 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DEFA4P12838 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DEFA4P12838 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DEFA4P12838 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DEFA4P12838 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DEFA4P12838 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DEFA4P12838 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DEFA4P12838 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DEFA4P12838 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DEFA4P12838 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DEFA4P12838 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DEFA4P12838 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DEFA4P12838 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DEFA4P12838 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DEFA4P12838 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DEFA4P12838 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DEFA4P12838 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DEFA4P12838 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DEFA4P12838 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DEFA4P12838 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DEFA4P12838 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DEFA4P12838 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DEFA4P12838 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DEFA4P12838 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DEFA4P12838 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DEFA4P12838 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DEFA4P12838 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DEFA4P12838 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DEFA4P12838 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
DEFA4P12838 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
DEFA4P12838 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
DEFA4P12838 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
DEFA4P12838 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
DEFA4P12838 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
DEFA4P12838 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
DEFA4P12838 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
DEFA4P12838 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
DEFA4P12838 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
DEFA4P12838 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
DEFA4P12838 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
DEFA4P12838 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
DEFA4P12838 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
DEFA4P12838 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
DEFA4P12838 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
DEFA4P12838 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
DEFA4P12838 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
DEFA4P12838 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
DEFA4P12838 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
DEFA4P12838 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
DEFA4P12838 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
DEFA4P12838 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
DEFA4P12838 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
DEFA4P12838 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
DEFA4P12838 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
DEFA4P12838 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
DEFA4P12838 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
DEFA4P12838 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
DEFA4P12838 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
DEFA4P12838 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
DEFA4P12838 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
DEFA4P12838 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
DEFA4P12838 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
DEFA4P12838 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
DEFA4P12838 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
DEFA4P12838 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
DEFA4P12838 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
DEFA4P12838 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
DEFA4P12838 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
DEFA4P12838 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
DEFA4P12838 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms