Protein–RNA interactions for Protein: P10144

GZMB, Granzyme B, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GZMBP10144 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GZMBP10144 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GZMBP10144 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GZMBP10144 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GZMBP10144 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GZMBP10144 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GZMBP10144 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GZMBP10144 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GZMBP10144 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GZMBP10144 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GZMBP10144 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GZMBP10144 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GZMBP10144 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GZMBP10144 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GZMBP10144 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GZMBP10144 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GZMBP10144 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GZMBP10144 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GZMBP10144 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GZMBP10144 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
GZMBP10144 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GZMBP10144 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GZMBP10144 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GZMBP10144 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GZMBP10144 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GZMBP10144 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GZMBP10144 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GZMBP10144 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GZMBP10144 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
GZMBP10144 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
GZMBP10144 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GZMBP10144 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GZMBP10144 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GZMBP10144 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GZMBP10144 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GZMBP10144 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GZMBP10144 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GZMBP10144 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GZMBP10144 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GZMBP10144 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GZMBP10144 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GZMBP10144 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GZMBP10144 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GZMBP10144 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GZMBP10144 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GZMBP10144 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GZMBP10144 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GZMBP10144 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GZMBP10144 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GZMBP10144 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GZMBP10144 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GZMBP10144 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GZMBP10144 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GZMBP10144 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GZMBP10144 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GZMBP10144 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GZMBP10144 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GZMBP10144 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GZMBP10144 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GZMBP10144 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GZMBP10144 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GZMBP10144 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
GZMBP10144 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GZMBP10144 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GZMBP10144 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GZMBP10144 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GZMBP10144 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GZMBP10144 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GZMBP10144 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GZMBP10144 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GZMBP10144 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GZMBP10144 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GZMBP10144 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GZMBP10144 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GZMBP10144 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GZMBP10144 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GZMBP10144 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GZMBP10144 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GZMBP10144 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GZMBP10144 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GZMBP10144 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GZMBP10144 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GZMBP10144 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GZMBP10144 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GZMBP10144 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GZMBP10144 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GZMBP10144 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GZMBP10144 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GZMBP10144 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GZMBP10144 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GZMBP10144 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GZMBP10144 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GZMBP10144 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GZMBP10144 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GZMBP10144 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GZMBP10144 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GZMBP10144 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GZMBP10144 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GZMBP10144 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GZMBP10144 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms