Protein–RNA interactions for Protein: P00338

LDHA, L-lactate dehydrogenase A chain, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDHAP00338 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LDHAP00338 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LDHAP00338 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LDHAP00338 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LDHAP00338 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LDHAP00338 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LDHAP00338 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LDHAP00338 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LDHAP00338 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LDHAP00338 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LDHAP00338 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LDHAP00338 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LDHAP00338 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LDHAP00338 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LDHAP00338 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LDHAP00338 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LDHAP00338 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LDHAP00338 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LDHAP00338 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LDHAP00338 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LDHAP00338 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LDHAP00338 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LDHAP00338 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LDHAP00338 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LDHAP00338 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LDHAP00338 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LDHAP00338 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LDHAP00338 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LDHAP00338 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LDHAP00338 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
LDHAP00338 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LDHAP00338 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LDHAP00338 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LDHAP00338 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
LDHAP00338 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LDHAP00338 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LDHAP00338 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LDHAP00338 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LDHAP00338 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LDHAP00338 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LDHAP00338 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LDHAP00338 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
LDHAP00338 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
LDHAP00338 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
LDHAP00338 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
LDHAP00338 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LDHAP00338 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LDHAP00338 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LDHAP00338 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LDHAP00338 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LDHAP00338 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
LDHAP00338 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LDHAP00338 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LDHAP00338 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LDHAP00338 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LDHAP00338 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LDHAP00338 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LDHAP00338 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LDHAP00338 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LDHAP00338 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LDHAP00338 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LDHAP00338 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LDHAP00338 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LDHAP00338 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
LDHAP00338 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LDHAP00338 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LDHAP00338 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LDHAP00338 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LDHAP00338 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LDHAP00338 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LDHAP00338 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
LDHAP00338 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LDHAP00338 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LDHAP00338 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LDHAP00338 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LDHAP00338 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LDHAP00338 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LDHAP00338 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LDHAP00338 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LDHAP00338 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LDHAP00338 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
LDHAP00338 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LDHAP00338 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LDHAP00338 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LDHAP00338 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LDHAP00338 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LDHAP00338 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LDHAP00338 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
LDHAP00338 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LDHAP00338 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LDHAP00338 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LDHAP00338 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LDHAP00338 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LDHAP00338 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LDHAP00338 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LDHAP00338 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
LDHAP00338 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LDHAP00338 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
LDHAP00338 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LDHAP00338 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms