Protein–RNA interactions for Protein: O95983

MBD3, Methyl-CpG-binding domain protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD3O95983 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MBD3O95983 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MBD3O95983 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MBD3O95983 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MBD3O95983 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MBD3O95983 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MBD3O95983 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MBD3O95983 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MBD3O95983 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MBD3O95983 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MBD3O95983 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
MBD3O95983 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MBD3O95983 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MBD3O95983 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MBD3O95983 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MBD3O95983 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MBD3O95983 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MBD3O95983 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MBD3O95983 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MBD3O95983 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MBD3O95983 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MBD3O95983 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MBD3O95983 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MBD3O95983 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MBD3O95983 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MBD3O95983 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MBD3O95983 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MBD3O95983 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MBD3O95983 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
MBD3O95983 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MBD3O95983 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MBD3O95983 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MBD3O95983 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MBD3O95983 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MBD3O95983 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MBD3O95983 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MBD3O95983 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MBD3O95983 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MBD3O95983 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
MBD3O95983 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MBD3O95983 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MBD3O95983 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MBD3O95983 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MBD3O95983 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MBD3O95983 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MBD3O95983 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MBD3O95983 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MBD3O95983 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MBD3O95983 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MBD3O95983 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MBD3O95983 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MBD3O95983 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MBD3O95983 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MBD3O95983 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MBD3O95983 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MBD3O95983 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MBD3O95983 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MBD3O95983 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MBD3O95983 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MBD3O95983 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
MBD3O95983 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MBD3O95983 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
MBD3O95983 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
MBD3O95983 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
MBD3O95983 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
MBD3O95983 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MBD3O95983 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
MBD3O95983 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MBD3O95983 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MBD3O95983 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
MBD3O95983 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
MBD3O95983 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
MBD3O95983 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
MBD3O95983 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
MBD3O95983 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
MBD3O95983 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MBD3O95983 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.36
MBD3O95983 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
MBD3O95983 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
MBD3O95983 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
MBD3O95983 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MBD3O95983 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MBD3O95983 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MBD3O95983 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MBD3O95983 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MBD3O95983 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MBD3O95983 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MBD3O95983 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MBD3O95983 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MBD3O95983 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MBD3O95983 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MBD3O95983 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MBD3O95983 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MBD3O95983 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MBD3O95983 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MBD3O95983 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MBD3O95983 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MBD3O95983 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MBD3O95983 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MBD3O95983 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms