Protein–RNA interactions for Protein: O75909

CCNK, Cyclin-K, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNKO75909 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CCNKO75909 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCNKO75909 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCNKO75909 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCNKO75909 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCNKO75909 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCNKO75909 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCNKO75909 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCNKO75909 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCNKO75909 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCNKO75909 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCNKO75909 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCNKO75909 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCNKO75909 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCNKO75909 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCNKO75909 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCNKO75909 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCNKO75909 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCNKO75909 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCNKO75909 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CCNKO75909 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCNKO75909 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCNKO75909 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCNKO75909 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCNKO75909 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCNKO75909 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCNKO75909 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CCNKO75909 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCNKO75909 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCNKO75909 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCNKO75909 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCNKO75909 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCNKO75909 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCNKO75909 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCNKO75909 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCNKO75909 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCNKO75909 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCNKO75909 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCNKO75909 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCNKO75909 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCNKO75909 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCNKO75909 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CCNKO75909 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCNKO75909 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCNKO75909 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCNKO75909 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCNKO75909 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCNKO75909 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCNKO75909 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCNKO75909 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCNKO75909 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCNKO75909 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCNKO75909 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCNKO75909 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCNKO75909 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCNKO75909 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCNKO75909 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCNKO75909 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCNKO75909 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCNKO75909 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCNKO75909 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCNKO75909 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCNKO75909 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCNKO75909 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCNKO75909 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCNKO75909 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCNKO75909 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCNKO75909 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCNKO75909 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCNKO75909 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCNKO75909 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCNKO75909 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCNKO75909 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCNKO75909 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCNKO75909 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCNKO75909 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCNKO75909 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCNKO75909 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCNKO75909 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCNKO75909 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCNKO75909 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCNKO75909 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CCNKO75909 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CCNKO75909 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CCNKO75909 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CCNKO75909 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CCNKO75909 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CCNKO75909 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCNKO75909 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCNKO75909 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCNKO75909 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCNKO75909 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCNKO75909 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCNKO75909 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCNKO75909 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCNKO75909 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCNKO75909 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCNKO75909 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCNKO75909 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCNKO75909 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms