Protein–RNA interactions for Protein: O75400

PRPF40A, Pre-mRNA-processing factor 40 homolog A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 957 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF40AO75400 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRPF40AO75400 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRPF40AO75400 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRPF40AO75400 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRPF40AO75400 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRPF40AO75400 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRPF40AO75400 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRPF40AO75400 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRPF40AO75400 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRPF40AO75400 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRPF40AO75400 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRPF40AO75400 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRPF40AO75400 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRPF40AO75400 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
PRPF40AO75400 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRPF40AO75400 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRPF40AO75400 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRPF40AO75400 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRPF40AO75400 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRPF40AO75400 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRPF40AO75400 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PRPF40AO75400 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PRPF40AO75400 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PRPF40AO75400 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PRPF40AO75400 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PRPF40AO75400 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PRPF40AO75400 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PRPF40AO75400 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PRPF40AO75400 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PRPF40AO75400 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PRPF40AO75400 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRPF40AO75400 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRPF40AO75400 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRPF40AO75400 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRPF40AO75400 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRPF40AO75400 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRPF40AO75400 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRPF40AO75400 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRPF40AO75400 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRPF40AO75400 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRPF40AO75400 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRPF40AO75400 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRPF40AO75400 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRPF40AO75400 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRPF40AO75400 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRPF40AO75400 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRPF40AO75400 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRPF40AO75400 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PRPF40AO75400 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PRPF40AO75400 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PRPF40AO75400 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PRPF40AO75400 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PRPF40AO75400 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PRPF40AO75400 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PRPF40AO75400 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PRPF40AO75400 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PRPF40AO75400 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PRPF40AO75400 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PRPF40AO75400 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PRPF40AO75400 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PRPF40AO75400 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
PRPF40AO75400 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PRPF40AO75400 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PRPF40AO75400 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
PRPF40AO75400 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PRPF40AO75400 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PRPF40AO75400 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
PRPF40AO75400 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
PRPF40AO75400 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PRPF40AO75400 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
PRPF40AO75400 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PRPF40AO75400 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PRPF40AO75400 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
PRPF40AO75400 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PRPF40AO75400 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PRPF40AO75400 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PRPF40AO75400 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PRPF40AO75400 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PRPF40AO75400 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PRPF40AO75400 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PRPF40AO75400 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PRPF40AO75400 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PRPF40AO75400 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PRPF40AO75400 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PRPF40AO75400 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PRPF40AO75400 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PRPF40AO75400 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PRPF40AO75400 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PRPF40AO75400 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PRPF40AO75400 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRPF40AO75400 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRPF40AO75400 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRPF40AO75400 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRPF40AO75400 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRPF40AO75400 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRPF40AO75400 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRPF40AO75400 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRPF40AO75400 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
PRPF40AO75400 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRPF40AO75400 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms