Protein–RNA interactions for Protein: O75379

VAMP4, Vesicle-associated membrane protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP4O75379 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
VAMP4O75379 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
VAMP4O75379 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
VAMP4O75379 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
VAMP4O75379 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
VAMP4O75379 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
VAMP4O75379 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
VAMP4O75379 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
VAMP4O75379 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
VAMP4O75379 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
VAMP4O75379 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
VAMP4O75379 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
VAMP4O75379 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
VAMP4O75379 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
VAMP4O75379 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
VAMP4O75379 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
VAMP4O75379 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
VAMP4O75379 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
VAMP4O75379 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
VAMP4O75379 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
VAMP4O75379 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC26.46■■□□□ 1.83
VAMP4O75379 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
VAMP4O75379 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
VAMP4O75379 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
VAMP4O75379 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
VAMP4O75379 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
VAMP4O75379 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
VAMP4O75379 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
VAMP4O75379 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
VAMP4O75379 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.83
VAMP4O75379 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
VAMP4O75379 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC26.45■■□□□ 1.82
VAMP4O75379 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC26.45■■□□□ 1.82
VAMP4O75379 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
VAMP4O75379 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
VAMP4O75379 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
VAMP4O75379 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
VAMP4O75379 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
VAMP4O75379 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
VAMP4O75379 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
VAMP4O75379 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
VAMP4O75379 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
VAMP4O75379 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
VAMP4O75379 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
VAMP4O75379 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
VAMP4O75379 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
VAMP4O75379 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
VAMP4O75379 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
VAMP4O75379 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
VAMP4O75379 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
VAMP4O75379 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
VAMP4O75379 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
VAMP4O75379 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
VAMP4O75379 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
VAMP4O75379 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
VAMP4O75379 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
VAMP4O75379 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
VAMP4O75379 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
VAMP4O75379 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
VAMP4O75379 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
VAMP4O75379 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
VAMP4O75379 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
VAMP4O75379 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
VAMP4O75379 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
VAMP4O75379 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
VAMP4O75379 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
VAMP4O75379 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
VAMP4O75379 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
VAMP4O75379 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
VAMP4O75379 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
VAMP4O75379 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
VAMP4O75379 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
VAMP4O75379 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC26.43■■□□□ 1.82
VAMP4O75379 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
VAMP4O75379 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
VAMP4O75379 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
VAMP4O75379 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
VAMP4O75379 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
VAMP4O75379 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
VAMP4O75379 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
VAMP4O75379 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
VAMP4O75379 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
VAMP4O75379 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
VAMP4O75379 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
VAMP4O75379 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
VAMP4O75379 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
VAMP4O75379 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
VAMP4O75379 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
VAMP4O75379 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
VAMP4O75379 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
VAMP4O75379 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
VAMP4O75379 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
VAMP4O75379 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
VAMP4O75379 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
VAMP4O75379 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
VAMP4O75379 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
VAMP4O75379 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
VAMP4O75379 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
VAMP4O75379 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
VAMP4O75379 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms