Protein–RNA interactions for Protein: O75145

PPFIA3, Liprin-alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA3O75145 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PPFIA3O75145 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PPFIA3O75145 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PPFIA3O75145 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PPFIA3O75145 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PPFIA3O75145 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PPFIA3O75145 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PPFIA3O75145 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PPFIA3O75145 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PPFIA3O75145 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PPFIA3O75145 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PPFIA3O75145 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PPFIA3O75145 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PPFIA3O75145 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PPFIA3O75145 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PPFIA3O75145 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PPFIA3O75145 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
PPFIA3O75145 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PPFIA3O75145 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PPFIA3O75145 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
PPFIA3O75145 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
PPFIA3O75145 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PPFIA3O75145 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PPFIA3O75145 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PPFIA3O75145 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PPFIA3O75145 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PPFIA3O75145 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PPFIA3O75145 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PPFIA3O75145 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PPFIA3O75145 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PPFIA3O75145 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PPFIA3O75145 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PPFIA3O75145 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PPFIA3O75145 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PPFIA3O75145 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PPFIA3O75145 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PPFIA3O75145 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PPFIA3O75145 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PPFIA3O75145 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PPFIA3O75145 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PPFIA3O75145 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PPFIA3O75145 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PPFIA3O75145 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
PPFIA3O75145 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PPFIA3O75145 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PPFIA3O75145 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PPFIA3O75145 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PPFIA3O75145 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PPFIA3O75145 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PPFIA3O75145 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PPFIA3O75145 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PPFIA3O75145 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PPFIA3O75145 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PPFIA3O75145 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PPFIA3O75145 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PPFIA3O75145 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PPFIA3O75145 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PPFIA3O75145 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
PPFIA3O75145 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PPFIA3O75145 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PPFIA3O75145 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PPFIA3O75145 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
PPFIA3O75145 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PPFIA3O75145 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
PPFIA3O75145 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
PPFIA3O75145 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PPFIA3O75145 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PPFIA3O75145 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PPFIA3O75145 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PPFIA3O75145 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PPFIA3O75145 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PPFIA3O75145 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PPFIA3O75145 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
PPFIA3O75145 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PPFIA3O75145 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PPFIA3O75145 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PPFIA3O75145 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PPFIA3O75145 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PPFIA3O75145 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PPFIA3O75145 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PPFIA3O75145 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PPFIA3O75145 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PPFIA3O75145 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PPFIA3O75145 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PPFIA3O75145 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PPFIA3O75145 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PPFIA3O75145 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PPFIA3O75145 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PPFIA3O75145 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PPFIA3O75145 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
PPFIA3O75145 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PPFIA3O75145 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PPFIA3O75145 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PPFIA3O75145 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PPFIA3O75145 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PPFIA3O75145 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PPFIA3O75145 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PPFIA3O75145 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PPFIA3O75145 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PPFIA3O75145 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms