Protein–RNA interactions for Protein: O60437

PPL, Periplakin, humanhuman

Predictions only

Length 1,756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPLO60437 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
PPLO60437 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
PPLO60437 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
PPLO60437 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
PPLO60437 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
PPLO60437 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
PPLO60437 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
PPLO60437 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
PPLO60437 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
PPLO60437 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
PPLO60437 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
PPLO60437 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
PPLO60437 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
PPLO60437 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
PPLO60437 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
PPLO60437 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
PPLO60437 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
PPLO60437 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
PPLO60437 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
PPLO60437 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
PPLO60437 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
PPLO60437 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
PPLO60437 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
PPLO60437 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
PPLO60437 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
PPLO60437 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
PPLO60437 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
PPLO60437 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
PPLO60437 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
PPLO60437 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
PPLO60437 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
PPLO60437 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
PPLO60437 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
PPLO60437 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
PPLO60437 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
PPLO60437 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC29.41■■■□□ 2.3
PPLO60437 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
PPLO60437 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
PPLO60437 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
PPLO60437 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
PPLO60437 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
PPLO60437 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
PPLO60437 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
PPLO60437 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
PPLO60437 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
PPLO60437 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
PPLO60437 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
PPLO60437 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
PPLO60437 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
PPLO60437 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
PPLO60437 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
PPLO60437 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
PPLO60437 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
PPLO60437 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
PPLO60437 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
PPLO60437 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC29.39■■■□□ 2.29
PPLO60437 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
PPLO60437 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.29
PPLO60437 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC29.39■■■□□ 2.29
PPLO60437 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.29
PPLO60437 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.29
PPLO60437 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.29
PPLO60437 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
PPLO60437 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
PPLO60437 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
PPLO60437 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
PPLO60437 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
PPLO60437 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
PPLO60437 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
PPLO60437 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
PPLO60437 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
PPLO60437 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
PPLO60437 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
PPLO60437 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
PPLO60437 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
PPLO60437 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
PPLO60437 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
PPLO60437 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
PPLO60437 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
PPLO60437 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
PPLO60437 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
PPLO60437 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
PPLO60437 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
PPLO60437 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
PPLO60437 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
PPLO60437 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
PPLO60437 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
PPLO60437 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
PPLO60437 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
PPLO60437 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
PPLO60437 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC29.36■■■□□ 2.29
PPLO60437 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
PPLO60437 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
PPLO60437 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
PPLO60437 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
PPLO60437 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
PPLO60437 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
PPLO60437 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
PPLO60437 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
PPLO60437 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms