Protein–RNA interactions for Protein: O60356

NUPR1, Nuclear protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 82 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUPR1O60356 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NUPR1O60356 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NUPR1O60356 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NUPR1O60356 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
NUPR1O60356 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NUPR1O60356 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NUPR1O60356 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
NUPR1O60356 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NUPR1O60356 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NUPR1O60356 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NUPR1O60356 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NUPR1O60356 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NUPR1O60356 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NUPR1O60356 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NUPR1O60356 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NUPR1O60356 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NUPR1O60356 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NUPR1O60356 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NUPR1O60356 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NUPR1O60356 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NUPR1O60356 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NUPR1O60356 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NUPR1O60356 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NUPR1O60356 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NUPR1O60356 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NUPR1O60356 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NUPR1O60356 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NUPR1O60356 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NUPR1O60356 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NUPR1O60356 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NUPR1O60356 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NUPR1O60356 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NUPR1O60356 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NUPR1O60356 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NUPR1O60356 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NUPR1O60356 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NUPR1O60356 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NUPR1O60356 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NUPR1O60356 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NUPR1O60356 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NUPR1O60356 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NUPR1O60356 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NUPR1O60356 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NUPR1O60356 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NUPR1O60356 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NUPR1O60356 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NUPR1O60356 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NUPR1O60356 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NUPR1O60356 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NUPR1O60356 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NUPR1O60356 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NUPR1O60356 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
NUPR1O60356 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
NUPR1O60356 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
NUPR1O60356 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
NUPR1O60356 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
NUPR1O60356 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
NUPR1O60356 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
NUPR1O60356 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
NUPR1O60356 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NUPR1O60356 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NUPR1O60356 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NUPR1O60356 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NUPR1O60356 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NUPR1O60356 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NUPR1O60356 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NUPR1O60356 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NUPR1O60356 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NUPR1O60356 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NUPR1O60356 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
NUPR1O60356 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NUPR1O60356 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NUPR1O60356 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NUPR1O60356 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NUPR1O60356 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NUPR1O60356 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NUPR1O60356 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NUPR1O60356 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NUPR1O60356 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NUPR1O60356 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NUPR1O60356 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NUPR1O60356 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NUPR1O60356 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NUPR1O60356 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NUPR1O60356 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NUPR1O60356 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NUPR1O60356 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NUPR1O60356 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NUPR1O60356 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NUPR1O60356 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NUPR1O60356 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NUPR1O60356 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NUPR1O60356 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NUPR1O60356 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NUPR1O60356 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NUPR1O60356 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NUPR1O60356 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NUPR1O60356 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NUPR1O60356 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NUPR1O60356 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms