Protein–RNA interactions for Protein: O60240

PLIN1, Perilipin-1, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLIN1O60240 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PLIN1O60240 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PLIN1O60240 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PLIN1O60240 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PLIN1O60240 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PLIN1O60240 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PLIN1O60240 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PLIN1O60240 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PLIN1O60240 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PLIN1O60240 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PLIN1O60240 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PLIN1O60240 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PLIN1O60240 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PLIN1O60240 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PLIN1O60240 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PLIN1O60240 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PLIN1O60240 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PLIN1O60240 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PLIN1O60240 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
PLIN1O60240 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
PLIN1O60240 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PLIN1O60240 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PLIN1O60240 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PLIN1O60240 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
PLIN1O60240 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PLIN1O60240 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PLIN1O60240 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
PLIN1O60240 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
PLIN1O60240 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC26.7■■□□□ 1.87
PLIN1O60240 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
PLIN1O60240 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PLIN1O60240 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PLIN1O60240 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PLIN1O60240 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PLIN1O60240 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PLIN1O60240 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PLIN1O60240 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PLIN1O60240 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PLIN1O60240 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PLIN1O60240 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PLIN1O60240 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PLIN1O60240 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PLIN1O60240 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PLIN1O60240 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PLIN1O60240 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PLIN1O60240 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PLIN1O60240 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PLIN1O60240 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PLIN1O60240 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
PLIN1O60240 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PLIN1O60240 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PLIN1O60240 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
PLIN1O60240 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PLIN1O60240 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
PLIN1O60240 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PLIN1O60240 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PLIN1O60240 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PLIN1O60240 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PLIN1O60240 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PLIN1O60240 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PLIN1O60240 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PLIN1O60240 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PLIN1O60240 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PLIN1O60240 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PLIN1O60240 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PLIN1O60240 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PLIN1O60240 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PLIN1O60240 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PLIN1O60240 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PLIN1O60240 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PLIN1O60240 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
PLIN1O60240 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PLIN1O60240 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PLIN1O60240 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PLIN1O60240 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PLIN1O60240 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PLIN1O60240 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PLIN1O60240 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PLIN1O60240 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PLIN1O60240 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PLIN1O60240 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PLIN1O60240 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PLIN1O60240 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PLIN1O60240 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PLIN1O60240 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PLIN1O60240 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PLIN1O60240 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PLIN1O60240 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PLIN1O60240 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PLIN1O60240 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PLIN1O60240 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PLIN1O60240 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PLIN1O60240 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PLIN1O60240 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
PLIN1O60240 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PLIN1O60240 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PLIN1O60240 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PLIN1O60240 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PLIN1O60240 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PLIN1O60240 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms