Protein–RNA interactions for Protein: O60231

DHX16, Putative pre-mRNA-splicing factor ATP-dependent RNA helicase DHX16, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,041 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DHX16O60231 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
DHX16O60231 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
DHX16O60231 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
DHX16O60231 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
DHX16O60231 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
DHX16O60231 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
DHX16O60231 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
DHX16O60231 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
DHX16O60231 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
DHX16O60231 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
DHX16O60231 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
DHX16O60231 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.48
DHX16O60231 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
DHX16O60231 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
DHX16O60231 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
DHX16O60231 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
DHX16O60231 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
DHX16O60231 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
DHX16O60231 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
DHX16O60231 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
DHX16O60231 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
DHX16O60231 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
DHX16O60231 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
DHX16O60231 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
DHX16O60231 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
DHX16O60231 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
DHX16O60231 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
DHX16O60231 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
DHX16O60231 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
DHX16O60231 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
DHX16O60231 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
DHX16O60231 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
DHX16O60231 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
DHX16O60231 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
DHX16O60231 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
DHX16O60231 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
DHX16O60231 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
DHX16O60231 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
DHX16O60231 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
DHX16O60231 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
DHX16O60231 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
DHX16O60231 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
DHX16O60231 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
DHX16O60231 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
DHX16O60231 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
DHX16O60231 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
DHX16O60231 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
DHX16O60231 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
DHX16O60231 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
DHX16O60231 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
DHX16O60231 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
DHX16O60231 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
DHX16O60231 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
DHX16O60231 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
DHX16O60231 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
DHX16O60231 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
DHX16O60231 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
DHX16O60231 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
DHX16O60231 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
DHX16O60231 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
DHX16O60231 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
DHX16O60231 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
DHX16O60231 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
DHX16O60231 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
DHX16O60231 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
DHX16O60231 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
DHX16O60231 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
DHX16O60231 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
DHX16O60231 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
DHX16O60231 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
DHX16O60231 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
DHX16O60231 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
DHX16O60231 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
DHX16O60231 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
DHX16O60231 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
DHX16O60231 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
DHX16O60231 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
DHX16O60231 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
DHX16O60231 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
DHX16O60231 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
DHX16O60231 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
DHX16O60231 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
DHX16O60231 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
DHX16O60231 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
DHX16O60231 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
DHX16O60231 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
DHX16O60231 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
DHX16O60231 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
DHX16O60231 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
DHX16O60231 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
DHX16O60231 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
DHX16O60231 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
DHX16O60231 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
DHX16O60231 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
DHX16O60231 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
DHX16O60231 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
DHX16O60231 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
DHX16O60231 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
DHX16O60231 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
DHX16O60231 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms