Protein–RNA interactions for Protein: O43707

ACTN4, Alpha-actinin-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN4O43707 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ACTN4O43707 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ACTN4O43707 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ACTN4O43707 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ACTN4O43707 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ACTN4O43707 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ACTN4O43707 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ACTN4O43707 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ACTN4O43707 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ACTN4O43707 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ACTN4O43707 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ACTN4O43707 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ACTN4O43707 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
ACTN4O43707 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ACTN4O43707 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ACTN4O43707 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ACTN4O43707 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ACTN4O43707 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ACTN4O43707 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
ACTN4O43707 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
ACTN4O43707 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ACTN4O43707 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ACTN4O43707 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ACTN4O43707 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ACTN4O43707 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ACTN4O43707 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ACTN4O43707 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ACTN4O43707 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ACTN4O43707 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ACTN4O43707 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ACTN4O43707 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ACTN4O43707 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ACTN4O43707 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ACTN4O43707 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ACTN4O43707 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ACTN4O43707 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ACTN4O43707 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ACTN4O43707 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ACTN4O43707 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ACTN4O43707 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ACTN4O43707 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ACTN4O43707 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ACTN4O43707 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ACTN4O43707 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ACTN4O43707 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ACTN4O43707 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ACTN4O43707 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ACTN4O43707 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ACTN4O43707 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ACTN4O43707 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ACTN4O43707 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ACTN4O43707 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ACTN4O43707 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ACTN4O43707 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ACTN4O43707 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ACTN4O43707 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ACTN4O43707 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ACTN4O43707 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ACTN4O43707 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ACTN4O43707 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ACTN4O43707 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ACTN4O43707 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ACTN4O43707 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ACTN4O43707 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ACTN4O43707 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ACTN4O43707 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
ACTN4O43707 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ACTN4O43707 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ACTN4O43707 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ACTN4O43707 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ACTN4O43707 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ACTN4O43707 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ACTN4O43707 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ACTN4O43707 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ACTN4O43707 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ACTN4O43707 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ACTN4O43707 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ACTN4O43707 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ACTN4O43707 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ACTN4O43707 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ACTN4O43707 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ACTN4O43707 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ACTN4O43707 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ACTN4O43707 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ACTN4O43707 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ACTN4O43707 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ACTN4O43707 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
ACTN4O43707 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ACTN4O43707 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ACTN4O43707 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ACTN4O43707 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ACTN4O43707 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ACTN4O43707 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ACTN4O43707 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ACTN4O43707 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ACTN4O43707 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
ACTN4O43707 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ACTN4O43707 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ACTN4O43707 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ACTN4O43707 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms