Protein–RNA interactions for Protein: O43526

KCNQ2, Potassium voltage-gated channel subfamily KQT member 2, humanhuman

Predictions only

Length 872 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNQ2O43526 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
KCNQ2O43526 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
KCNQ2O43526 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
KCNQ2O43526 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
KCNQ2O43526 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
KCNQ2O43526 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
KCNQ2O43526 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
KCNQ2O43526 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
KCNQ2O43526 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
KCNQ2O43526 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
KCNQ2O43526 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC26.86■■□□□ 1.89
KCNQ2O43526 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
KCNQ2O43526 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
KCNQ2O43526 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC26.86■■□□□ 1.89
KCNQ2O43526 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
KCNQ2O43526 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
KCNQ2O43526 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
KCNQ2O43526 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC26.86■■□□□ 1.89
KCNQ2O43526 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
KCNQ2O43526 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
KCNQ2O43526 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
KCNQ2O43526 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
KCNQ2O43526 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
KCNQ2O43526 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
KCNQ2O43526 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
KCNQ2O43526 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
KCNQ2O43526 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
KCNQ2O43526 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
KCNQ2O43526 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
KCNQ2O43526 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
KCNQ2O43526 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
KCNQ2O43526 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC26.85■■□□□ 1.89
KCNQ2O43526 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
KCNQ2O43526 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
KCNQ2O43526 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
KCNQ2O43526 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
KCNQ2O43526 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
KCNQ2O43526 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
KCNQ2O43526 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
KCNQ2O43526 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
KCNQ2O43526 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
KCNQ2O43526 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
KCNQ2O43526 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
KCNQ2O43526 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
KCNQ2O43526 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
KCNQ2O43526 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
KCNQ2O43526 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
KCNQ2O43526 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
KCNQ2O43526 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
KCNQ2O43526 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
KCNQ2O43526 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
KCNQ2O43526 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
KCNQ2O43526 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
KCNQ2O43526 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
KCNQ2O43526 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
KCNQ2O43526 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
KCNQ2O43526 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC26.83■■□□□ 1.89
KCNQ2O43526 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
KCNQ2O43526 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
KCNQ2O43526 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
KCNQ2O43526 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
KCNQ2O43526 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
KCNQ2O43526 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
KCNQ2O43526 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
KCNQ2O43526 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
KCNQ2O43526 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
KCNQ2O43526 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
KCNQ2O43526 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
KCNQ2O43526 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
KCNQ2O43526 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
KCNQ2O43526 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
KCNQ2O43526 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
KCNQ2O43526 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
KCNQ2O43526 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
KCNQ2O43526 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
KCNQ2O43526 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
KCNQ2O43526 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
KCNQ2O43526 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
KCNQ2O43526 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
KCNQ2O43526 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
KCNQ2O43526 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
KCNQ2O43526 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
KCNQ2O43526 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
KCNQ2O43526 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
KCNQ2O43526 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
KCNQ2O43526 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
KCNQ2O43526 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
KCNQ2O43526 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
KCNQ2O43526 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
KCNQ2O43526 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
KCNQ2O43526 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
KCNQ2O43526 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
KCNQ2O43526 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
KCNQ2O43526 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
KCNQ2O43526 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
KCNQ2O43526 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
KCNQ2O43526 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
KCNQ2O43526 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
KCNQ2O43526 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
KCNQ2O43526 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms