Protein–RNA interactions for Protein: O43524

FOXO3, Forkhead box protein O3, humanhuman

Predictions only

Length 673 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXO3O43524 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
FOXO3O43524 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
FOXO3O43524 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
FOXO3O43524 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
FOXO3O43524 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
FOXO3O43524 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
FOXO3O43524 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
FOXO3O43524 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
FOXO3O43524 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
FOXO3O43524 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
FOXO3O43524 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
FOXO3O43524 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
FOXO3O43524 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
FOXO3O43524 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
FOXO3O43524 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
FOXO3O43524 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
FOXO3O43524 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
FOXO3O43524 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
FOXO3O43524 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
FOXO3O43524 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
FOXO3O43524 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
FOXO3O43524 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
FOXO3O43524 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
FOXO3O43524 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
FOXO3O43524 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
FOXO3O43524 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
FOXO3O43524 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
FOXO3O43524 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
FOXO3O43524 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
FOXO3O43524 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
FOXO3O43524 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
FOXO3O43524 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC28.39■■■□□ 2.13
FOXO3O43524 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
FOXO3O43524 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
FOXO3O43524 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
FOXO3O43524 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
FOXO3O43524 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
FOXO3O43524 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
FOXO3O43524 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
FOXO3O43524 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC28.38■■■□□ 2.13
FOXO3O43524 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
FOXO3O43524 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
FOXO3O43524 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
FOXO3O43524 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
FOXO3O43524 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
FOXO3O43524 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
FOXO3O43524 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
FOXO3O43524 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
FOXO3O43524 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
FOXO3O43524 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
FOXO3O43524 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
FOXO3O43524 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
FOXO3O43524 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
FOXO3O43524 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
FOXO3O43524 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
FOXO3O43524 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
FOXO3O43524 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
FOXO3O43524 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
FOXO3O43524 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
FOXO3O43524 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
FOXO3O43524 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
FOXO3O43524 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
FOXO3O43524 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
FOXO3O43524 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
FOXO3O43524 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
FOXO3O43524 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
FOXO3O43524 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
FOXO3O43524 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
FOXO3O43524 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
FOXO3O43524 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC28.36■■■□□ 2.13
FOXO3O43524 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
FOXO3O43524 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
FOXO3O43524 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
FOXO3O43524 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
FOXO3O43524 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
FOXO3O43524 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
FOXO3O43524 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
FOXO3O43524 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
FOXO3O43524 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
FOXO3O43524 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
FOXO3O43524 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
FOXO3O43524 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
FOXO3O43524 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
FOXO3O43524 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
FOXO3O43524 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
FOXO3O43524 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
FOXO3O43524 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
FOXO3O43524 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
FOXO3O43524 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
FOXO3O43524 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
FOXO3O43524 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
FOXO3O43524 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
FOXO3O43524 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
FOXO3O43524 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
FOXO3O43524 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
FOXO3O43524 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
FOXO3O43524 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
FOXO3O43524 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
FOXO3O43524 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
FOXO3O43524 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms