Protein–RNA interactions for Protein: O43189

PHF1, PHD finger protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF1O43189 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PHF1O43189 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PHF1O43189 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PHF1O43189 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PHF1O43189 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PHF1O43189 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PHF1O43189 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
PHF1O43189 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PHF1O43189 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PHF1O43189 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PHF1O43189 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PHF1O43189 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PHF1O43189 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PHF1O43189 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
PHF1O43189 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PHF1O43189 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PHF1O43189 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PHF1O43189 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PHF1O43189 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PHF1O43189 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PHF1O43189 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PHF1O43189 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PHF1O43189 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PHF1O43189 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PHF1O43189 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PHF1O43189 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PHF1O43189 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PHF1O43189 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PHF1O43189 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PHF1O43189 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PHF1O43189 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PHF1O43189 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PHF1O43189 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PHF1O43189 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PHF1O43189 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PHF1O43189 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PHF1O43189 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PHF1O43189 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PHF1O43189 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PHF1O43189 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PHF1O43189 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PHF1O43189 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PHF1O43189 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PHF1O43189 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PHF1O43189 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PHF1O43189 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PHF1O43189 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PHF1O43189 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PHF1O43189 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PHF1O43189 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PHF1O43189 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PHF1O43189 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PHF1O43189 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PHF1O43189 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PHF1O43189 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PHF1O43189 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PHF1O43189 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PHF1O43189 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
PHF1O43189 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PHF1O43189 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PHF1O43189 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PHF1O43189 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PHF1O43189 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PHF1O43189 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
PHF1O43189 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PHF1O43189 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PHF1O43189 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PHF1O43189 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PHF1O43189 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PHF1O43189 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PHF1O43189 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PHF1O43189 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PHF1O43189 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PHF1O43189 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PHF1O43189 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PHF1O43189 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PHF1O43189 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PHF1O43189 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PHF1O43189 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PHF1O43189 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PHF1O43189 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PHF1O43189 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PHF1O43189 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PHF1O43189 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PHF1O43189 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PHF1O43189 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PHF1O43189 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PHF1O43189 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PHF1O43189 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PHF1O43189 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
PHF1O43189 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PHF1O43189 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
PHF1O43189 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PHF1O43189 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PHF1O43189 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
PHF1O43189 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
PHF1O43189 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
PHF1O43189 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
PHF1O43189 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PHF1O43189 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms