Protein–RNA interactions for Protein: O43157

PLXNB1, Plexin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 2,135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXNB1O43157 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PLXNB1O43157 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PLXNB1O43157 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PLXNB1O43157 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PLXNB1O43157 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PLXNB1O43157 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PLXNB1O43157 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
PLXNB1O43157 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PLXNB1O43157 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
PLXNB1O43157 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
PLXNB1O43157 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PLXNB1O43157 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PLXNB1O43157 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
PLXNB1O43157 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PLXNB1O43157 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PLXNB1O43157 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PLXNB1O43157 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PLXNB1O43157 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PLXNB1O43157 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PLXNB1O43157 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PLXNB1O43157 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PLXNB1O43157 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PLXNB1O43157 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PLXNB1O43157 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PLXNB1O43157 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PLXNB1O43157 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PLXNB1O43157 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PLXNB1O43157 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PLXNB1O43157 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PLXNB1O43157 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PLXNB1O43157 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PLXNB1O43157 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PLXNB1O43157 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PLXNB1O43157 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PLXNB1O43157 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PLXNB1O43157 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PLXNB1O43157 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PLXNB1O43157 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PLXNB1O43157 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PLXNB1O43157 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PLXNB1O43157 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PLXNB1O43157 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PLXNB1O43157 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PLXNB1O43157 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PLXNB1O43157 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PLXNB1O43157 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PLXNB1O43157 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PLXNB1O43157 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PLXNB1O43157 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PLXNB1O43157 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PLXNB1O43157 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PLXNB1O43157 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PLXNB1O43157 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PLXNB1O43157 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PLXNB1O43157 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PLXNB1O43157 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PLXNB1O43157 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PLXNB1O43157 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PLXNB1O43157 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PLXNB1O43157 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PLXNB1O43157 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
PLXNB1O43157 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PLXNB1O43157 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PLXNB1O43157 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PLXNB1O43157 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PLXNB1O43157 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PLXNB1O43157 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PLXNB1O43157 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PLXNB1O43157 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PLXNB1O43157 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PLXNB1O43157 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PLXNB1O43157 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PLXNB1O43157 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PLXNB1O43157 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PLXNB1O43157 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PLXNB1O43157 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PLXNB1O43157 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PLXNB1O43157 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PLXNB1O43157 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
PLXNB1O43157 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PLXNB1O43157 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PLXNB1O43157 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PLXNB1O43157 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PLXNB1O43157 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PLXNB1O43157 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PLXNB1O43157 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PLXNB1O43157 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PLXNB1O43157 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
PLXNB1O43157 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
PLXNB1O43157 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PLXNB1O43157 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PLXNB1O43157 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PLXNB1O43157 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PLXNB1O43157 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PLXNB1O43157 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PLXNB1O43157 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PLXNB1O43157 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PLXNB1O43157 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PLXNB1O43157 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PLXNB1O43157 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms