Protein–RNA interactions for Protein: O15399

GRIN2D, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2D, humanhuman

Predictions only

Length 1,336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2DO15399 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GRIN2DO15399 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GRIN2DO15399 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GRIN2DO15399 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GRIN2DO15399 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GRIN2DO15399 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GRIN2DO15399 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GRIN2DO15399 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GRIN2DO15399 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GRIN2DO15399 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GRIN2DO15399 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GRIN2DO15399 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GRIN2DO15399 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GRIN2DO15399 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GRIN2DO15399 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GRIN2DO15399 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GRIN2DO15399 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GRIN2DO15399 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GRIN2DO15399 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GRIN2DO15399 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GRIN2DO15399 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GRIN2DO15399 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
GRIN2DO15399 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GRIN2DO15399 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GRIN2DO15399 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GRIN2DO15399 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GRIN2DO15399 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GRIN2DO15399 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GRIN2DO15399 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GRIN2DO15399 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GRIN2DO15399 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
GRIN2DO15399 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GRIN2DO15399 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GRIN2DO15399 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GRIN2DO15399 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GRIN2DO15399 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GRIN2DO15399 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GRIN2DO15399 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GRIN2DO15399 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GRIN2DO15399 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GRIN2DO15399 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GRIN2DO15399 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GRIN2DO15399 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GRIN2DO15399 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GRIN2DO15399 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GRIN2DO15399 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GRIN2DO15399 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GRIN2DO15399 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GRIN2DO15399 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GRIN2DO15399 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GRIN2DO15399 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GRIN2DO15399 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GRIN2DO15399 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GRIN2DO15399 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GRIN2DO15399 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GRIN2DO15399 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
GRIN2DO15399 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.3
GRIN2DO15399 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
GRIN2DO15399 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
GRIN2DO15399 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
GRIN2DO15399 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GRIN2DO15399 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GRIN2DO15399 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GRIN2DO15399 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GRIN2DO15399 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GRIN2DO15399 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GRIN2DO15399 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GRIN2DO15399 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
GRIN2DO15399 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GRIN2DO15399 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
GRIN2DO15399 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
GRIN2DO15399 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
GRIN2DO15399 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
GRIN2DO15399 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GRIN2DO15399 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
GRIN2DO15399 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GRIN2DO15399 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GRIN2DO15399 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GRIN2DO15399 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GRIN2DO15399 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GRIN2DO15399 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GRIN2DO15399 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GRIN2DO15399 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GRIN2DO15399 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GRIN2DO15399 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GRIN2DO15399 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GRIN2DO15399 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GRIN2DO15399 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GRIN2DO15399 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GRIN2DO15399 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
GRIN2DO15399 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GRIN2DO15399 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GRIN2DO15399 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GRIN2DO15399 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GRIN2DO15399 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GRIN2DO15399 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GRIN2DO15399 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GRIN2DO15399 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GRIN2DO15399 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GRIN2DO15399 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms