Protein–RNA interactions for Protein: O15047

SETD1A, Histone-lysine N-methyltransferase SETD1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETD1AO15047 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
SETD1AO15047 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
SETD1AO15047 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
SETD1AO15047 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
SETD1AO15047 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
SETD1AO15047 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
SETD1AO15047 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
SETD1AO15047 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
SETD1AO15047 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
SETD1AO15047 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
SETD1AO15047 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
SETD1AO15047 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
SETD1AO15047 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
SETD1AO15047 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
SETD1AO15047 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
SETD1AO15047 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
SETD1AO15047 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
SETD1AO15047 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
SETD1AO15047 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
SETD1AO15047 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
SETD1AO15047 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
SETD1AO15047 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
SETD1AO15047 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
SETD1AO15047 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
SETD1AO15047 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
SETD1AO15047 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
SETD1AO15047 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
SETD1AO15047 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
SETD1AO15047 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC29.17■■■□□ 2.26
SETD1AO15047 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
SETD1AO15047 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
SETD1AO15047 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
SETD1AO15047 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
SETD1AO15047 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
SETD1AO15047 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
SETD1AO15047 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
SETD1AO15047 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
SETD1AO15047 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
SETD1AO15047 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
SETD1AO15047 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
SETD1AO15047 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
SETD1AO15047 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
SETD1AO15047 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
SETD1AO15047 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
SETD1AO15047 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
SETD1AO15047 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
SETD1AO15047 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
SETD1AO15047 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
SETD1AO15047 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
SETD1AO15047 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
SETD1AO15047 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
SETD1AO15047 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
SETD1AO15047 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
SETD1AO15047 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
SETD1AO15047 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
SETD1AO15047 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
SETD1AO15047 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
SETD1AO15047 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
SETD1AO15047 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
SETD1AO15047 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
SETD1AO15047 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
SETD1AO15047 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
SETD1AO15047 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
SETD1AO15047 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
SETD1AO15047 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
SETD1AO15047 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
SETD1AO15047 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
SETD1AO15047 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
SETD1AO15047 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
SETD1AO15047 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC29.14■■■□□ 2.26
SETD1AO15047 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
SETD1AO15047 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
SETD1AO15047 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
SETD1AO15047 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
SETD1AO15047 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
SETD1AO15047 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.25
SETD1AO15047 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC29.14■■■□□ 2.25
SETD1AO15047 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SETD1AO15047 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SETD1AO15047 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
SETD1AO15047 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
SETD1AO15047 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
SETD1AO15047 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SETD1AO15047 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
SETD1AO15047 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
SETD1AO15047 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
SETD1AO15047 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
SETD1AO15047 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
SETD1AO15047 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
SETD1AO15047 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC29.12■■■□□ 2.25
SETD1AO15047 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
SETD1AO15047 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
SETD1AO15047 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
SETD1AO15047 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
SETD1AO15047 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
SETD1AO15047 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
SETD1AO15047 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
SETD1AO15047 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
SETD1AO15047 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
SETD1AO15047 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms