Protein–RNA interactions for Protein: O14802

POLR3A, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3AO14802 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
POLR3AO14802 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
POLR3AO14802 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
POLR3AO14802 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
POLR3AO14802 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
POLR3AO14802 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
POLR3AO14802 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
POLR3AO14802 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
POLR3AO14802 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
POLR3AO14802 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
POLR3AO14802 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
POLR3AO14802 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
POLR3AO14802 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
POLR3AO14802 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
POLR3AO14802 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
POLR3AO14802 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
POLR3AO14802 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
POLR3AO14802 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC28.46■■■□□ 2.15
POLR3AO14802 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
POLR3AO14802 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC28.46■■■□□ 2.15
POLR3AO14802 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
POLR3AO14802 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
POLR3AO14802 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
POLR3AO14802 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
POLR3AO14802 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.46■■■□□ 2.15
POLR3AO14802 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
POLR3AO14802 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
POLR3AO14802 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
POLR3AO14802 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
POLR3AO14802 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
POLR3AO14802 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
POLR3AO14802 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
POLR3AO14802 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
POLR3AO14802 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
POLR3AO14802 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
POLR3AO14802 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
POLR3AO14802 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
POLR3AO14802 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC28.45■■■□□ 2.14
POLR3AO14802 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
POLR3AO14802 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
POLR3AO14802 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
POLR3AO14802 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
POLR3AO14802 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
POLR3AO14802 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
POLR3AO14802 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
POLR3AO14802 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
POLR3AO14802 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
POLR3AO14802 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
POLR3AO14802 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
POLR3AO14802 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
POLR3AO14802 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
POLR3AO14802 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
POLR3AO14802 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
POLR3AO14802 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
POLR3AO14802 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
POLR3AO14802 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
POLR3AO14802 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
POLR3AO14802 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
POLR3AO14802 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
POLR3AO14802 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
POLR3AO14802 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
POLR3AO14802 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
POLR3AO14802 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
POLR3AO14802 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
POLR3AO14802 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
POLR3AO14802 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
POLR3AO14802 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
POLR3AO14802 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
POLR3AO14802 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
POLR3AO14802 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
POLR3AO14802 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
POLR3AO14802 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
POLR3AO14802 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
POLR3AO14802 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
POLR3AO14802 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
POLR3AO14802 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
POLR3AO14802 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
POLR3AO14802 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
POLR3AO14802 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
POLR3AO14802 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
POLR3AO14802 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
POLR3AO14802 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
POLR3AO14802 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
POLR3AO14802 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
POLR3AO14802 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
POLR3AO14802 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
POLR3AO14802 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
POLR3AO14802 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
POLR3AO14802 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
POLR3AO14802 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
POLR3AO14802 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
POLR3AO14802 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
POLR3AO14802 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
POLR3AO14802 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
POLR3AO14802 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
POLR3AO14802 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
POLR3AO14802 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
POLR3AO14802 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
POLR3AO14802 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
POLR3AO14802 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms