Protein–RNA interactions for Protein: O00628

PEX7, Peroxisomal targeting signal 2 receptor, humanhuman

Predictions only

Length 323 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX7O00628 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PEX7O00628 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PEX7O00628 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PEX7O00628 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PEX7O00628 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PEX7O00628 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PEX7O00628 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PEX7O00628 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PEX7O00628 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PEX7O00628 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PEX7O00628 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PEX7O00628 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PEX7O00628 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PEX7O00628 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PEX7O00628 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PEX7O00628 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PEX7O00628 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PEX7O00628 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PEX7O00628 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PEX7O00628 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PEX7O00628 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PEX7O00628 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PEX7O00628 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PEX7O00628 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PEX7O00628 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PEX7O00628 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PEX7O00628 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PEX7O00628 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PEX7O00628 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PEX7O00628 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PEX7O00628 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PEX7O00628 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PEX7O00628 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PEX7O00628 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PEX7O00628 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PEX7O00628 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PEX7O00628 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PEX7O00628 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PEX7O00628 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PEX7O00628 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PEX7O00628 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PEX7O00628 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PEX7O00628 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PEX7O00628 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PEX7O00628 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PEX7O00628 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PEX7O00628 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PEX7O00628 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PEX7O00628 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PEX7O00628 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PEX7O00628 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PEX7O00628 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PEX7O00628 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PEX7O00628 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PEX7O00628 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PEX7O00628 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PEX7O00628 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PEX7O00628 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PEX7O00628 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PEX7O00628 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PEX7O00628 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PEX7O00628 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PEX7O00628 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PEX7O00628 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PEX7O00628 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PEX7O00628 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PEX7O00628 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PEX7O00628 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PEX7O00628 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PEX7O00628 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PEX7O00628 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PEX7O00628 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PEX7O00628 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PEX7O00628 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PEX7O00628 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PEX7O00628 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PEX7O00628 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PEX7O00628 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PEX7O00628 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PEX7O00628 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PEX7O00628 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PEX7O00628 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PEX7O00628 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PEX7O00628 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PEX7O00628 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PEX7O00628 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PEX7O00628 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PEX7O00628 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PEX7O00628 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PEX7O00628 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PEX7O00628 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PEX7O00628 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PEX7O00628 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PEX7O00628 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PEX7O00628 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PEX7O00628 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PEX7O00628 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PEX7O00628 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PEX7O00628 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PEX7O00628 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms