Protein–RNA interactions for Protein: O00295

TULP2, Tubby-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TULP2O00295 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TULP2O00295 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TULP2O00295 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TULP2O00295 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TULP2O00295 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TULP2O00295 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TULP2O00295 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TULP2O00295 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TULP2O00295 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TULP2O00295 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TULP2O00295 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TULP2O00295 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TULP2O00295 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TULP2O00295 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TULP2O00295 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TULP2O00295 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TULP2O00295 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TULP2O00295 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
TULP2O00295 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TULP2O00295 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TULP2O00295 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TULP2O00295 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TULP2O00295 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TULP2O00295 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TULP2O00295 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
TULP2O00295 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TULP2O00295 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TULP2O00295 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TULP2O00295 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TULP2O00295 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TULP2O00295 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TULP2O00295 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TULP2O00295 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TULP2O00295 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TULP2O00295 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TULP2O00295 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TULP2O00295 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
TULP2O00295 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
TULP2O00295 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TULP2O00295 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TULP2O00295 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TULP2O00295 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TULP2O00295 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TULP2O00295 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TULP2O00295 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TULP2O00295 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TULP2O00295 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TULP2O00295 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TULP2O00295 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TULP2O00295 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
TULP2O00295 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
TULP2O00295 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TULP2O00295 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TULP2O00295 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TULP2O00295 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TULP2O00295 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TULP2O00295 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TULP2O00295 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TULP2O00295 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TULP2O00295 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TULP2O00295 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TULP2O00295 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TULP2O00295 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TULP2O00295 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TULP2O00295 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TULP2O00295 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TULP2O00295 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TULP2O00295 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TULP2O00295 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TULP2O00295 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TULP2O00295 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TULP2O00295 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TULP2O00295 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TULP2O00295 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TULP2O00295 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TULP2O00295 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TULP2O00295 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TULP2O00295 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TULP2O00295 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TULP2O00295 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TULP2O00295 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TULP2O00295 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TULP2O00295 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
TULP2O00295 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
TULP2O00295 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TULP2O00295 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TULP2O00295 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TULP2O00295 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
TULP2O00295 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TULP2O00295 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TULP2O00295 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TULP2O00295 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TULP2O00295 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TULP2O00295 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TULP2O00295 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
TULP2O00295 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TULP2O00295 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TULP2O00295 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TULP2O00295 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TULP2O00295 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms