Protein–RNA interactions for Protein: H7C1C5

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 153 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H7C1C5 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
H7C1C5 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
H7C1C5 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
H7C1C5 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
H7C1C5 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
H7C1C5 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
H7C1C5 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
H7C1C5 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
H7C1C5 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
H7C1C5 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
H7C1C5 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
H7C1C5 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
H7C1C5 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
H7C1C5 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
H7C1C5 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
H7C1C5 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
H7C1C5 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
H7C1C5 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
H7C1C5 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
H7C1C5 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
H7C1C5 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
H7C1C5 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
H7C1C5 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
H7C1C5 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
H7C1C5 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
H7C1C5 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
H7C1C5 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
H7C1C5 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
H7C1C5 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
H7C1C5 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
H7C1C5 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
H7C1C5 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
H7C1C5 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
H7C1C5 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
H7C1C5 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
H7C1C5 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
H7C1C5 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
H7C1C5 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
H7C1C5 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
H7C1C5 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
H7C1C5 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
H7C1C5 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
H7C1C5 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
H7C1C5 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
H7C1C5 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
H7C1C5 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
H7C1C5 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
H7C1C5 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
H7C1C5 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
H7C1C5 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
H7C1C5 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
H7C1C5 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
H7C1C5 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
H7C1C5 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
H7C1C5 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
H7C1C5 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
H7C1C5 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
H7C1C5 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
H7C1C5 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
H7C1C5 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
H7C1C5 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
H7C1C5 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
H7C1C5 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
H7C1C5 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
H7C1C5 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
H7C1C5 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
H7C1C5 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
H7C1C5 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
H7C1C5 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
H7C1C5 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
H7C1C5 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
H7C1C5 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
H7C1C5 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
H7C1C5 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
H7C1C5 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
H7C1C5 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
H7C1C5 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
H7C1C5 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
H7C1C5 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
H7C1C5 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
H7C1C5 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
H7C1C5 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
H7C1C5 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
H7C1C5 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
H7C1C5 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
H7C1C5 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
H7C1C5 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
H7C1C5 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
H7C1C5 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
H7C1C5 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
H7C1C5 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
H7C1C5 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
H7C1C5 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
H7C1C5 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
H7C1C5 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
H7C1C5 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
H7C1C5 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
H7C1C5 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
H7C1C5 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
H7C1C5 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms