Protein–RNA interactions for Protein: E9PBE3

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E9PBE3 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
E9PBE3 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
E9PBE3 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
E9PBE3 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
E9PBE3 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
E9PBE3 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
E9PBE3 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
E9PBE3 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
E9PBE3 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
E9PBE3 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
E9PBE3 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
E9PBE3 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
E9PBE3 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
E9PBE3 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
E9PBE3 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
E9PBE3 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
E9PBE3 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
E9PBE3 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
E9PBE3 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
E9PBE3 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
E9PBE3 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
E9PBE3 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
E9PBE3 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
E9PBE3 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
E9PBE3 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
E9PBE3 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
E9PBE3 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
E9PBE3 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
E9PBE3 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
E9PBE3 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
E9PBE3 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
E9PBE3 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
E9PBE3 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
E9PBE3 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
E9PBE3 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
E9PBE3 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
E9PBE3 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
E9PBE3 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
E9PBE3 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
E9PBE3 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
E9PBE3 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
E9PBE3 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
E9PBE3 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
E9PBE3 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
E9PBE3 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
E9PBE3 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
E9PBE3 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
E9PBE3 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
E9PBE3 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
E9PBE3 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
E9PBE3 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
E9PBE3 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
E9PBE3 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
E9PBE3 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
E9PBE3 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
E9PBE3 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
E9PBE3 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
E9PBE3 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
E9PBE3 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
E9PBE3 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
E9PBE3 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
E9PBE3 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
E9PBE3 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
E9PBE3 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
E9PBE3 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
E9PBE3 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
E9PBE3 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
E9PBE3 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
E9PBE3 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
E9PBE3 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
E9PBE3 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
E9PBE3 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
E9PBE3 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
E9PBE3 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
E9PBE3 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
E9PBE3 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
E9PBE3 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
E9PBE3 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
E9PBE3 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
E9PBE3 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
E9PBE3 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
E9PBE3 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
E9PBE3 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
E9PBE3 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
E9PBE3 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
E9PBE3 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
E9PBE3 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
E9PBE3 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
E9PBE3 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
E9PBE3 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
E9PBE3 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
E9PBE3 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
E9PBE3 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
E9PBE3 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
E9PBE3 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
E9PBE3 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
E9PBE3 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
E9PBE3 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
E9PBE3 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
E9PBE3 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.7 ms