Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH9

ERVV-2, Endogenous retrovirus group V member 2 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-2B6SEH9 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ERVV-2B6SEH9 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ERVV-2B6SEH9 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
ERVV-2B6SEH9 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
ERVV-2B6SEH9 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ERVV-2B6SEH9 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ERVV-2B6SEH9 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ERVV-2B6SEH9 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ERVV-2B6SEH9 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ERVV-2B6SEH9 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ERVV-2B6SEH9 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ERVV-2B6SEH9 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ERVV-2B6SEH9 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ERVV-2B6SEH9 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ERVV-2B6SEH9 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ERVV-2B6SEH9 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ERVV-2B6SEH9 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ERVV-2B6SEH9 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ERVV-2B6SEH9 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ERVV-2B6SEH9 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ERVV-2B6SEH9 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ERVV-2B6SEH9 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ERVV-2B6SEH9 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ERVV-2B6SEH9 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ERVV-2B6SEH9 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ERVV-2B6SEH9 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ERVV-2B6SEH9 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ERVV-2B6SEH9 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ERVV-2B6SEH9 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
ERVV-2B6SEH9 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ERVV-2B6SEH9 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ERVV-2B6SEH9 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ERVV-2B6SEH9 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ERVV-2B6SEH9 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
ERVV-2B6SEH9 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ERVV-2B6SEH9 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ERVV-2B6SEH9 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ERVV-2B6SEH9 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
ERVV-2B6SEH9 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
ERVV-2B6SEH9 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
ERVV-2B6SEH9 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
ERVV-2B6SEH9 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
ERVV-2B6SEH9 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
ERVV-2B6SEH9 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
ERVV-2B6SEH9 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
ERVV-2B6SEH9 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC26.7■■□□□ 1.86
ERVV-2B6SEH9 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
ERVV-2B6SEH9 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
ERVV-2B6SEH9 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ERVV-2B6SEH9 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ERVV-2B6SEH9 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ERVV-2B6SEH9 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ERVV-2B6SEH9 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ERVV-2B6SEH9 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ERVV-2B6SEH9 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ERVV-2B6SEH9 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ERVV-2B6SEH9 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ERVV-2B6SEH9 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ERVV-2B6SEH9 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
ERVV-2B6SEH9 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
ERVV-2B6SEH9 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ERVV-2B6SEH9 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ERVV-2B6SEH9 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ERVV-2B6SEH9 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ERVV-2B6SEH9 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ERVV-2B6SEH9 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ERVV-2B6SEH9 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ERVV-2B6SEH9 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ERVV-2B6SEH9 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ERVV-2B6SEH9 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ERVV-2B6SEH9 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ERVV-2B6SEH9 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ERVV-2B6SEH9 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ERVV-2B6SEH9 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ERVV-2B6SEH9 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ERVV-2B6SEH9 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ERVV-2B6SEH9 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ERVV-2B6SEH9 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ERVV-2B6SEH9 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ERVV-2B6SEH9 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ERVV-2B6SEH9 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
ERVV-2B6SEH9 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ERVV-2B6SEH9 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
ERVV-2B6SEH9 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
ERVV-2B6SEH9 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ERVV-2B6SEH9 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
ERVV-2B6SEH9 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
ERVV-2B6SEH9 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ERVV-2B6SEH9 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
ERVV-2B6SEH9 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ERVV-2B6SEH9 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ERVV-2B6SEH9 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
ERVV-2B6SEH9 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
ERVV-2B6SEH9 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
ERVV-2B6SEH9 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
ERVV-2B6SEH9 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
ERVV-2B6SEH9 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ERVV-2B6SEH9 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
ERVV-2B6SEH9 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
ERVV-2B6SEH9 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms