Protein–RNA interactions for Protein: A8K830

COLCA2, Colorectal cancer-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COLCA2A8K830 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
COLCA2A8K830 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
COLCA2A8K830 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
COLCA2A8K830 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
COLCA2A8K830 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
COLCA2A8K830 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
COLCA2A8K830 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
COLCA2A8K830 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
COLCA2A8K830 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
COLCA2A8K830 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
COLCA2A8K830 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
COLCA2A8K830 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
COLCA2A8K830 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
COLCA2A8K830 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
COLCA2A8K830 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
COLCA2A8K830 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
COLCA2A8K830 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
COLCA2A8K830 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
COLCA2A8K830 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
COLCA2A8K830 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
COLCA2A8K830 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
COLCA2A8K830 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
COLCA2A8K830 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
COLCA2A8K830 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
COLCA2A8K830 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
COLCA2A8K830 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
COLCA2A8K830 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
COLCA2A8K830 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
COLCA2A8K830 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
COLCA2A8K830 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
COLCA2A8K830 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
COLCA2A8K830 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
COLCA2A8K830 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
COLCA2A8K830 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
COLCA2A8K830 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
COLCA2A8K830 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
COLCA2A8K830 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
COLCA2A8K830 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
COLCA2A8K830 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
COLCA2A8K830 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
COLCA2A8K830 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
COLCA2A8K830 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
COLCA2A8K830 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
COLCA2A8K830 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
COLCA2A8K830 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
COLCA2A8K830 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
COLCA2A8K830 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
COLCA2A8K830 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
COLCA2A8K830 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
COLCA2A8K830 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
COLCA2A8K830 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
COLCA2A8K830 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
COLCA2A8K830 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
COLCA2A8K830 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
COLCA2A8K830 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
COLCA2A8K830 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
COLCA2A8K830 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
COLCA2A8K830 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
COLCA2A8K830 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
COLCA2A8K830 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
COLCA2A8K830 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
COLCA2A8K830 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
COLCA2A8K830 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
COLCA2A8K830 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
COLCA2A8K830 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
COLCA2A8K830 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
COLCA2A8K830 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
COLCA2A8K830 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
COLCA2A8K830 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
COLCA2A8K830 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
COLCA2A8K830 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
COLCA2A8K830 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
COLCA2A8K830 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
COLCA2A8K830 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
COLCA2A8K830 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
COLCA2A8K830 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
COLCA2A8K830 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
COLCA2A8K830 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
COLCA2A8K830 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
COLCA2A8K830 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
COLCA2A8K830 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
COLCA2A8K830 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
COLCA2A8K830 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
COLCA2A8K830 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
COLCA2A8K830 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
COLCA2A8K830 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
COLCA2A8K830 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
COLCA2A8K830 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
COLCA2A8K830 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
COLCA2A8K830 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
COLCA2A8K830 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
COLCA2A8K830 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
COLCA2A8K830 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
COLCA2A8K830 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
COLCA2A8K830 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
COLCA2A8K830 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
COLCA2A8K830 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
COLCA2A8K830 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
COLCA2A8K830 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
COLCA2A8K830 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms