Protein–RNA interactions for Protein: A6NI79

CCDC69, Coiled-coil domain-containing protein 69, humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC69A6NI79 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC69A6NI79 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC69A6NI79 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC69A6NI79 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC69A6NI79 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC69A6NI79 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC69A6NI79 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC69A6NI79 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC69A6NI79 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC69A6NI79 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC69A6NI79 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC69A6NI79 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC69A6NI79 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC69A6NI79 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC69A6NI79 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC69A6NI79 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC69A6NI79 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC69A6NI79 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC69A6NI79 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC69A6NI79 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC69A6NI79 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC69A6NI79 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC69A6NI79 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC69A6NI79 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC69A6NI79 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC69A6NI79 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC69A6NI79 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC69A6NI79 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC69A6NI79 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC69A6NI79 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC69A6NI79 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC69A6NI79 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC69A6NI79 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC69A6NI79 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC69A6NI79 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC69A6NI79 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC69A6NI79 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC69A6NI79 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC69A6NI79 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC69A6NI79 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC69A6NI79 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC69A6NI79 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC69A6NI79 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC69A6NI79 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC69A6NI79 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC69A6NI79 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC69A6NI79 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC69A6NI79 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC69A6NI79 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC69A6NI79 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC69A6NI79 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC69A6NI79 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC69A6NI79 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC69A6NI79 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC69A6NI79 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC69A6NI79 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC69A6NI79 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC69A6NI79 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC69A6NI79 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC69A6NI79 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC69A6NI79 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC69A6NI79 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC69A6NI79 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC69A6NI79 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC69A6NI79 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC69A6NI79 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC69A6NI79 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC69A6NI79 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC69A6NI79 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC69A6NI79 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC69A6NI79 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC69A6NI79 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC69A6NI79 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC69A6NI79 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC69A6NI79 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC69A6NI79 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC69A6NI79 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC69A6NI79 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC69A6NI79 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
CCDC69A6NI79 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CCDC69A6NI79 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CCDC69A6NI79 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CCDC69A6NI79 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC69A6NI79 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC69A6NI79 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC69A6NI79 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC69A6NI79 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC69A6NI79 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC69A6NI79 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC69A6NI79 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC69A6NI79 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC69A6NI79 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC69A6NI79 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC69A6NI79 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC69A6NI79 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC69A6NI79 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC69A6NI79 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC69A6NI79 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC69A6NI79 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC69A6NI79 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms