Protein–RNA interactions for Protein: A6NFT4

CFAP73, Cilia- and flagella-associated protein 73, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP73A6NFT4 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CFAP73A6NFT4 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CFAP73A6NFT4 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CFAP73A6NFT4 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CFAP73A6NFT4 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CFAP73A6NFT4 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CFAP73A6NFT4 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CFAP73A6NFT4 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CFAP73A6NFT4 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CFAP73A6NFT4 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CFAP73A6NFT4 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
CFAP73A6NFT4 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CFAP73A6NFT4 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CFAP73A6NFT4 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
CFAP73A6NFT4 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CFAP73A6NFT4 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CFAP73A6NFT4 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CFAP73A6NFT4 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CFAP73A6NFT4 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CFAP73A6NFT4 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CFAP73A6NFT4 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CFAP73A6NFT4 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CFAP73A6NFT4 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CFAP73A6NFT4 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CFAP73A6NFT4 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CFAP73A6NFT4 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CFAP73A6NFT4 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CFAP73A6NFT4 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CFAP73A6NFT4 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CFAP73A6NFT4 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CFAP73A6NFT4 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CFAP73A6NFT4 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CFAP73A6NFT4 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CFAP73A6NFT4 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CFAP73A6NFT4 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CFAP73A6NFT4 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CFAP73A6NFT4 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CFAP73A6NFT4 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CFAP73A6NFT4 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CFAP73A6NFT4 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CFAP73A6NFT4 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CFAP73A6NFT4 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
CFAP73A6NFT4 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CFAP73A6NFT4 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
CFAP73A6NFT4 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CFAP73A6NFT4 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CFAP73A6NFT4 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CFAP73A6NFT4 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CFAP73A6NFT4 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CFAP73A6NFT4 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CFAP73A6NFT4 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CFAP73A6NFT4 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CFAP73A6NFT4 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CFAP73A6NFT4 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CFAP73A6NFT4 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CFAP73A6NFT4 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CFAP73A6NFT4 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CFAP73A6NFT4 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CFAP73A6NFT4 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CFAP73A6NFT4 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CFAP73A6NFT4 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CFAP73A6NFT4 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CFAP73A6NFT4 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CFAP73A6NFT4 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CFAP73A6NFT4 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CFAP73A6NFT4 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CFAP73A6NFT4 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CFAP73A6NFT4 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CFAP73A6NFT4 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CFAP73A6NFT4 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CFAP73A6NFT4 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
CFAP73A6NFT4 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CFAP73A6NFT4 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CFAP73A6NFT4 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CFAP73A6NFT4 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CFAP73A6NFT4 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CFAP73A6NFT4 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CFAP73A6NFT4 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
CFAP73A6NFT4 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CFAP73A6NFT4 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CFAP73A6NFT4 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CFAP73A6NFT4 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CFAP73A6NFT4 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CFAP73A6NFT4 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CFAP73A6NFT4 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CFAP73A6NFT4 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CFAP73A6NFT4 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CFAP73A6NFT4 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CFAP73A6NFT4 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CFAP73A6NFT4 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CFAP73A6NFT4 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CFAP73A6NFT4 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CFAP73A6NFT4 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CFAP73A6NFT4 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CFAP73A6NFT4 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CFAP73A6NFT4 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CFAP73A6NFT4 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CFAP73A6NFT4 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CFAP73A6NFT4 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CFAP73A6NFT4 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms