Protein–RNA interactions for Protein: A6NDN3

GOLGA6B, Golgin subfamily A member 6B, humanhuman

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6BA6NDN3 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GOLGA6BA6NDN3 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GOLGA6BA6NDN3 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GOLGA6BA6NDN3 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GOLGA6BA6NDN3 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GOLGA6BA6NDN3 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GOLGA6BA6NDN3 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GOLGA6BA6NDN3 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GOLGA6BA6NDN3 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GOLGA6BA6NDN3 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
GOLGA6BA6NDN3 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GOLGA6BA6NDN3 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GOLGA6BA6NDN3 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GOLGA6BA6NDN3 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GOLGA6BA6NDN3 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GOLGA6BA6NDN3 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GOLGA6BA6NDN3 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GOLGA6BA6NDN3 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GOLGA6BA6NDN3 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GOLGA6BA6NDN3 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GOLGA6BA6NDN3 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GOLGA6BA6NDN3 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GOLGA6BA6NDN3 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GOLGA6BA6NDN3 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GOLGA6BA6NDN3 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GOLGA6BA6NDN3 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GOLGA6BA6NDN3 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GOLGA6BA6NDN3 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GOLGA6BA6NDN3 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GOLGA6BA6NDN3 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GOLGA6BA6NDN3 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GOLGA6BA6NDN3 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
GOLGA6BA6NDN3 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GOLGA6BA6NDN3 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GOLGA6BA6NDN3 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GOLGA6BA6NDN3 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GOLGA6BA6NDN3 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GOLGA6BA6NDN3 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GOLGA6BA6NDN3 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GOLGA6BA6NDN3 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GOLGA6BA6NDN3 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GOLGA6BA6NDN3 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GOLGA6BA6NDN3 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GOLGA6BA6NDN3 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GOLGA6BA6NDN3 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GOLGA6BA6NDN3 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GOLGA6BA6NDN3 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GOLGA6BA6NDN3 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GOLGA6BA6NDN3 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GOLGA6BA6NDN3 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
GOLGA6BA6NDN3 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GOLGA6BA6NDN3 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GOLGA6BA6NDN3 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GOLGA6BA6NDN3 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GOLGA6BA6NDN3 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GOLGA6BA6NDN3 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GOLGA6BA6NDN3 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GOLGA6BA6NDN3 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GOLGA6BA6NDN3 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GOLGA6BA6NDN3 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GOLGA6BA6NDN3 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GOLGA6BA6NDN3 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GOLGA6BA6NDN3 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GOLGA6BA6NDN3 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GOLGA6BA6NDN3 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GOLGA6BA6NDN3 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GOLGA6BA6NDN3 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
GOLGA6BA6NDN3 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GOLGA6BA6NDN3 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
GOLGA6BA6NDN3 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GOLGA6BA6NDN3 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GOLGA6BA6NDN3 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GOLGA6BA6NDN3 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GOLGA6BA6NDN3 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GOLGA6BA6NDN3 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GOLGA6BA6NDN3 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GOLGA6BA6NDN3 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GOLGA6BA6NDN3 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GOLGA6BA6NDN3 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GOLGA6BA6NDN3 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GOLGA6BA6NDN3 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GOLGA6BA6NDN3 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GOLGA6BA6NDN3 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GOLGA6BA6NDN3 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GOLGA6BA6NDN3 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GOLGA6BA6NDN3 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GOLGA6BA6NDN3 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GOLGA6BA6NDN3 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GOLGA6BA6NDN3 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GOLGA6BA6NDN3 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GOLGA6BA6NDN3 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GOLGA6BA6NDN3 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GOLGA6BA6NDN3 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GOLGA6BA6NDN3 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GOLGA6BA6NDN3 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
GOLGA6BA6NDN3 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
GOLGA6BA6NDN3 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GOLGA6BA6NDN3 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GOLGA6BA6NDN3 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GOLGA6BA6NDN3 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms