Protein–RNA interactions for Protein: A6NCL1

GMNC, Geminin coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GMNCA6NCL1 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GMNCA6NCL1 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GMNCA6NCL1 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GMNCA6NCL1 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GMNCA6NCL1 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GMNCA6NCL1 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GMNCA6NCL1 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GMNCA6NCL1 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GMNCA6NCL1 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
GMNCA6NCL1 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GMNCA6NCL1 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
GMNCA6NCL1 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
GMNCA6NCL1 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
GMNCA6NCL1 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GMNCA6NCL1 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
GMNCA6NCL1 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GMNCA6NCL1 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
GMNCA6NCL1 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GMNCA6NCL1 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GMNCA6NCL1 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GMNCA6NCL1 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC20.62■□□□□ 0.89
GMNCA6NCL1 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GMNCA6NCL1 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
GMNCA6NCL1 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
GMNCA6NCL1 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GMNCA6NCL1 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
GMNCA6NCL1 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GMNCA6NCL1 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GMNCA6NCL1 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GMNCA6NCL1 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GMNCA6NCL1 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GMNCA6NCL1 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GMNCA6NCL1 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GMNCA6NCL1 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GMNCA6NCL1 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GMNCA6NCL1 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GMNCA6NCL1 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GMNCA6NCL1 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GMNCA6NCL1 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
GMNCA6NCL1 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GMNCA6NCL1 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GMNCA6NCL1 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GMNCA6NCL1 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GMNCA6NCL1 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GMNCA6NCL1 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GMNCA6NCL1 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GMNCA6NCL1 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GMNCA6NCL1 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GMNCA6NCL1 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GMNCA6NCL1 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GMNCA6NCL1 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GMNCA6NCL1 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GMNCA6NCL1 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GMNCA6NCL1 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GMNCA6NCL1 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GMNCA6NCL1 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
GMNCA6NCL1 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GMNCA6NCL1 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GMNCA6NCL1 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GMNCA6NCL1 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GMNCA6NCL1 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
GMNCA6NCL1 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
GMNCA6NCL1 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GMNCA6NCL1 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GMNCA6NCL1 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GMNCA6NCL1 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GMNCA6NCL1 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GMNCA6NCL1 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GMNCA6NCL1 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GMNCA6NCL1 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GMNCA6NCL1 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GMNCA6NCL1 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GMNCA6NCL1 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GMNCA6NCL1 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
GMNCA6NCL1 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GMNCA6NCL1 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GMNCA6NCL1 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GMNCA6NCL1 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GMNCA6NCL1 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GMNCA6NCL1 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GMNCA6NCL1 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GMNCA6NCL1 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GMNCA6NCL1 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GMNCA6NCL1 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GMNCA6NCL1 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GMNCA6NCL1 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GMNCA6NCL1 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GMNCA6NCL1 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
GMNCA6NCL1 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
GMNCA6NCL1 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
GMNCA6NCL1 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
GMNCA6NCL1 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
GMNCA6NCL1 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
GMNCA6NCL1 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
GMNCA6NCL1 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
GMNCA6NCL1 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
GMNCA6NCL1 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
GMNCA6NCL1 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
GMNCA6NCL1 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
GMNCA6NCL1 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms