Protein–RNA interactions for Protein: A4D0T7

SMIM30, Small integral membrane protein 30, humanhuman

Predictions only

Length 59 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM30A4D0T7 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMIM30A4D0T7 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMIM30A4D0T7 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMIM30A4D0T7 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMIM30A4D0T7 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMIM30A4D0T7 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMIM30A4D0T7 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMIM30A4D0T7 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMIM30A4D0T7 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMIM30A4D0T7 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMIM30A4D0T7 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMIM30A4D0T7 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMIM30A4D0T7 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMIM30A4D0T7 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SMIM30A4D0T7 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SMIM30A4D0T7 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMIM30A4D0T7 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMIM30A4D0T7 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMIM30A4D0T7 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMIM30A4D0T7 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMIM30A4D0T7 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMIM30A4D0T7 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMIM30A4D0T7 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMIM30A4D0T7 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMIM30A4D0T7 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMIM30A4D0T7 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMIM30A4D0T7 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMIM30A4D0T7 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SMIM30A4D0T7 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SMIM30A4D0T7 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SMIM30A4D0T7 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SMIM30A4D0T7 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SMIM30A4D0T7 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SMIM30A4D0T7 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SMIM30A4D0T7 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SMIM30A4D0T7 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SMIM30A4D0T7 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SMIM30A4D0T7 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SMIM30A4D0T7 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SMIM30A4D0T7 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SMIM30A4D0T7 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SMIM30A4D0T7 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SMIM30A4D0T7 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SMIM30A4D0T7 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SMIM30A4D0T7 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SMIM30A4D0T7 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SMIM30A4D0T7 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SMIM30A4D0T7 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SMIM30A4D0T7 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SMIM30A4D0T7 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SMIM30A4D0T7 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
SMIM30A4D0T7 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SMIM30A4D0T7 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SMIM30A4D0T7 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SMIM30A4D0T7 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SMIM30A4D0T7 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SMIM30A4D0T7 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SMIM30A4D0T7 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SMIM30A4D0T7 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SMIM30A4D0T7 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SMIM30A4D0T7 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SMIM30A4D0T7 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SMIM30A4D0T7 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SMIM30A4D0T7 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SMIM30A4D0T7 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SMIM30A4D0T7 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SMIM30A4D0T7 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SMIM30A4D0T7 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SMIM30A4D0T7 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SMIM30A4D0T7 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SMIM30A4D0T7 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SMIM30A4D0T7 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SMIM30A4D0T7 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SMIM30A4D0T7 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SMIM30A4D0T7 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SMIM30A4D0T7 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SMIM30A4D0T7 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SMIM30A4D0T7 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SMIM30A4D0T7 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SMIM30A4D0T7 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SMIM30A4D0T7 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SMIM30A4D0T7 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SMIM30A4D0T7 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SMIM30A4D0T7 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SMIM30A4D0T7 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SMIM30A4D0T7 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SMIM30A4D0T7 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SMIM30A4D0T7 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SMIM30A4D0T7 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SMIM30A4D0T7 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SMIM30A4D0T7 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SMIM30A4D0T7 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SMIM30A4D0T7 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SMIM30A4D0T7 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SMIM30A4D0T7 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SMIM30A4D0T7 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SMIM30A4D0T7 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SMIM30A4D0T7 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SMIM30A4D0T7 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SMIM30A4D0T7 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms