Protein–RNA interactions for Protein: A2A2Y4

FRMD3, FERM domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMD3A2A2Y4 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FRMD3A2A2Y4 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
FRMD3A2A2Y4 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FRMD3A2A2Y4 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
FRMD3A2A2Y4 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FRMD3A2A2Y4 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FRMD3A2A2Y4 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FRMD3A2A2Y4 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
FRMD3A2A2Y4 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
FRMD3A2A2Y4 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
FRMD3A2A2Y4 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FRMD3A2A2Y4 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FRMD3A2A2Y4 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FRMD3A2A2Y4 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FRMD3A2A2Y4 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FRMD3A2A2Y4 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FRMD3A2A2Y4 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FRMD3A2A2Y4 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FRMD3A2A2Y4 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
FRMD3A2A2Y4 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FRMD3A2A2Y4 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FRMD3A2A2Y4 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FRMD3A2A2Y4 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FRMD3A2A2Y4 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
FRMD3A2A2Y4 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FRMD3A2A2Y4 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FRMD3A2A2Y4 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FRMD3A2A2Y4 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FRMD3A2A2Y4 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FRMD3A2A2Y4 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FRMD3A2A2Y4 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FRMD3A2A2Y4 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
FRMD3A2A2Y4 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
FRMD3A2A2Y4 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
FRMD3A2A2Y4 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FRMD3A2A2Y4 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FRMD3A2A2Y4 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FRMD3A2A2Y4 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FRMD3A2A2Y4 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FRMD3A2A2Y4 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FRMD3A2A2Y4 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FRMD3A2A2Y4 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FRMD3A2A2Y4 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FRMD3A2A2Y4 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FRMD3A2A2Y4 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FRMD3A2A2Y4 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FRMD3A2A2Y4 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FRMD3A2A2Y4 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FRMD3A2A2Y4 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FRMD3A2A2Y4 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
FRMD3A2A2Y4 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FRMD3A2A2Y4 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FRMD3A2A2Y4 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FRMD3A2A2Y4 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FRMD3A2A2Y4 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FRMD3A2A2Y4 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FRMD3A2A2Y4 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FRMD3A2A2Y4 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
FRMD3A2A2Y4 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FRMD3A2A2Y4 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FRMD3A2A2Y4 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FRMD3A2A2Y4 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FRMD3A2A2Y4 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FRMD3A2A2Y4 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FRMD3A2A2Y4 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FRMD3A2A2Y4 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FRMD3A2A2Y4 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FRMD3A2A2Y4 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FRMD3A2A2Y4 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FRMD3A2A2Y4 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FRMD3A2A2Y4 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FRMD3A2A2Y4 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FRMD3A2A2Y4 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FRMD3A2A2Y4 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FRMD3A2A2Y4 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FRMD3A2A2Y4 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FRMD3A2A2Y4 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
FRMD3A2A2Y4 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FRMD3A2A2Y4 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FRMD3A2A2Y4 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FRMD3A2A2Y4 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FRMD3A2A2Y4 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FRMD3A2A2Y4 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FRMD3A2A2Y4 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FRMD3A2A2Y4 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FRMD3A2A2Y4 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FRMD3A2A2Y4 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FRMD3A2A2Y4 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FRMD3A2A2Y4 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FRMD3A2A2Y4 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FRMD3A2A2Y4 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FRMD3A2A2Y4 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FRMD3A2A2Y4 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FRMD3A2A2Y4 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FRMD3A2A2Y4 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FRMD3A2A2Y4 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FRMD3A2A2Y4 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FRMD3A2A2Y4 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FRMD3A2A2Y4 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FRMD3A2A2Y4 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms