Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6C7

LINC00312, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00312, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00312Q9Y6C7 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
LINC00312Q9Y6C7 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LINC00312Q9Y6C7 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
LINC00312Q9Y6C7 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
LINC00312Q9Y6C7 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LINC00312Q9Y6C7 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LINC00312Q9Y6C7 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
LINC00312Q9Y6C7 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LINC00312Q9Y6C7 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
LINC00312Q9Y6C7 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
LINC00312Q9Y6C7 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LINC00312Q9Y6C7 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
LINC00312Q9Y6C7 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
LINC00312Q9Y6C7 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
LINC00312Q9Y6C7 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
LINC00312Q9Y6C7 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LINC00312Q9Y6C7 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LINC00312Q9Y6C7 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
LINC00312Q9Y6C7 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LINC00312Q9Y6C7 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
LINC00312Q9Y6C7 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LINC00312Q9Y6C7 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LINC00312Q9Y6C7 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LINC00312Q9Y6C7 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LINC00312Q9Y6C7 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LINC00312Q9Y6C7 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LINC00312Q9Y6C7 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
LINC00312Q9Y6C7 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LINC00312Q9Y6C7 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC17.05■□□□□ 0.32
LINC00312Q9Y6C7 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
LINC00312Q9Y6C7 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LINC00312Q9Y6C7 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LINC00312Q9Y6C7 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
LINC00312Q9Y6C7 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
LINC00312Q9Y6C7 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
LINC00312Q9Y6C7 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
LINC00312Q9Y6C7 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
LINC00312Q9Y6C7 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
LINC00312Q9Y6C7 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
LINC00312Q9Y6C7 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LINC00312Q9Y6C7 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LINC00312Q9Y6C7 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
LINC00312Q9Y6C7 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LINC00312Q9Y6C7 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LINC00312Q9Y6C7 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LINC00312Q9Y6C7 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LINC00312Q9Y6C7 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LINC00312Q9Y6C7 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LINC00312Q9Y6C7 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
LINC00312Q9Y6C7 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LINC00312Q9Y6C7 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LINC00312Q9Y6C7 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LINC00312Q9Y6C7 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LINC00312Q9Y6C7 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LINC00312Q9Y6C7 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LINC00312Q9Y6C7 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LINC00312Q9Y6C7 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
LINC00312Q9Y6C7 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
LINC00312Q9Y6C7 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
LINC00312Q9Y6C7 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
LINC00312Q9Y6C7 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
LINC00312Q9Y6C7 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
LINC00312Q9Y6C7 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LINC00312Q9Y6C7 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
LINC00312Q9Y6C7 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
LINC00312Q9Y6C7 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LINC00312Q9Y6C7 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
LINC00312Q9Y6C7 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LINC00312Q9Y6C7 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LINC00312Q9Y6C7 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LINC00312Q9Y6C7 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
LINC00312Q9Y6C7 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LINC00312Q9Y6C7 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LINC00312Q9Y6C7 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
LINC00312Q9Y6C7 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
LINC00312Q9Y6C7 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
LINC00312Q9Y6C7 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LINC00312Q9Y6C7 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LINC00312Q9Y6C7 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
LINC00312Q9Y6C7 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
LINC00312Q9Y6C7 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
LINC00312Q9Y6C7 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
LINC00312Q9Y6C7 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LINC00312Q9Y6C7 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
LINC00312Q9Y6C7 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LINC00312Q9Y6C7 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LINC00312Q9Y6C7 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LINC00312Q9Y6C7 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LINC00312Q9Y6C7 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LINC00312Q9Y6C7 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LINC00312Q9Y6C7 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LINC00312Q9Y6C7 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LINC00312Q9Y6C7 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LINC00312Q9Y6C7 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LINC00312Q9Y6C7 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LINC00312Q9Y6C7 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
LINC00312Q9Y6C7 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
LINC00312Q9Y6C7 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
LINC00312Q9Y6C7 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
LINC00312Q9Y6C7 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms