Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5Q9

GTF3C3, General transcription factor 3C polypeptide 3, humanhuman

Predictions only

Length 886 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C3Q9Y5Q9 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
GTF3C3Q9Y5Q9 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
GTF3C3Q9Y5Q9 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
GTF3C3Q9Y5Q9 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
GTF3C3Q9Y5Q9 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
GTF3C3Q9Y5Q9 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
GTF3C3Q9Y5Q9 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
GTF3C3Q9Y5Q9 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
GTF3C3Q9Y5Q9 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.02
GTF3C3Q9Y5Q9 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
GTF3C3Q9Y5Q9 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
GTF3C3Q9Y5Q9 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
GTF3C3Q9Y5Q9 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
GTF3C3Q9Y5Q9 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
GTF3C3Q9Y5Q9 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
GTF3C3Q9Y5Q9 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
GTF3C3Q9Y5Q9 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
GTF3C3Q9Y5Q9 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
GTF3C3Q9Y5Q9 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
GTF3C3Q9Y5Q9 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
GTF3C3Q9Y5Q9 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
GTF3C3Q9Y5Q9 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
GTF3C3Q9Y5Q9 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
GTF3C3Q9Y5Q9 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
GTF3C3Q9Y5Q9 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
GTF3C3Q9Y5Q9 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
GTF3C3Q9Y5Q9 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
GTF3C3Q9Y5Q9 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
GTF3C3Q9Y5Q9 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
GTF3C3Q9Y5Q9 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
GTF3C3Q9Y5Q9 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
GTF3C3Q9Y5Q9 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
GTF3C3Q9Y5Q9 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
GTF3C3Q9Y5Q9 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
GTF3C3Q9Y5Q9 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
GTF3C3Q9Y5Q9 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
GTF3C3Q9Y5Q9 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
GTF3C3Q9Y5Q9 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
GTF3C3Q9Y5Q9 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
GTF3C3Q9Y5Q9 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
GTF3C3Q9Y5Q9 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
GTF3C3Q9Y5Q9 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
GTF3C3Q9Y5Q9 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
GTF3C3Q9Y5Q9 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
GTF3C3Q9Y5Q9 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
GTF3C3Q9Y5Q9 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
GTF3C3Q9Y5Q9 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
GTF3C3Q9Y5Q9 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
GTF3C3Q9Y5Q9 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
GTF3C3Q9Y5Q9 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
GTF3C3Q9Y5Q9 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
GTF3C3Q9Y5Q9 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
GTF3C3Q9Y5Q9 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
GTF3C3Q9Y5Q9 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
GTF3C3Q9Y5Q9 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
GTF3C3Q9Y5Q9 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
GTF3C3Q9Y5Q9 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
GTF3C3Q9Y5Q9 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
GTF3C3Q9Y5Q9 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
GTF3C3Q9Y5Q9 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
GTF3C3Q9Y5Q9 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
GTF3C3Q9Y5Q9 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
GTF3C3Q9Y5Q9 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
GTF3C3Q9Y5Q9 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
GTF3C3Q9Y5Q9 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
GTF3C3Q9Y5Q9 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
GTF3C3Q9Y5Q9 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
GTF3C3Q9Y5Q9 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
GTF3C3Q9Y5Q9 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
GTF3C3Q9Y5Q9 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
GTF3C3Q9Y5Q9 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
GTF3C3Q9Y5Q9 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
GTF3C3Q9Y5Q9 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
GTF3C3Q9Y5Q9 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
GTF3C3Q9Y5Q9 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
GTF3C3Q9Y5Q9 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
GTF3C3Q9Y5Q9 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
GTF3C3Q9Y5Q9 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
GTF3C3Q9Y5Q9 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
GTF3C3Q9Y5Q9 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
GTF3C3Q9Y5Q9 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
GTF3C3Q9Y5Q9 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
GTF3C3Q9Y5Q9 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
GTF3C3Q9Y5Q9 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
GTF3C3Q9Y5Q9 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
GTF3C3Q9Y5Q9 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
GTF3C3Q9Y5Q9 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
GTF3C3Q9Y5Q9 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
GTF3C3Q9Y5Q9 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
GTF3C3Q9Y5Q9 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
GTF3C3Q9Y5Q9 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
GTF3C3Q9Y5Q9 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
GTF3C3Q9Y5Q9 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
GTF3C3Q9Y5Q9 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
GTF3C3Q9Y5Q9 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
GTF3C3Q9Y5Q9 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
GTF3C3Q9Y5Q9 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
GTF3C3Q9Y5Q9 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
GTF3C3Q9Y5Q9 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
GTF3C3Q9Y5Q9 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms