Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5M8

SRPRB, Signal recognition particle receptor subunit beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRPRBQ9Y5M8 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SRPRBQ9Y5M8 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SRPRBQ9Y5M8 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SRPRBQ9Y5M8 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SRPRBQ9Y5M8 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SRPRBQ9Y5M8 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SRPRBQ9Y5M8 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SRPRBQ9Y5M8 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SRPRBQ9Y5M8 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SRPRBQ9Y5M8 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SRPRBQ9Y5M8 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SRPRBQ9Y5M8 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SRPRBQ9Y5M8 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SRPRBQ9Y5M8 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SRPRBQ9Y5M8 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SRPRBQ9Y5M8 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SRPRBQ9Y5M8 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SRPRBQ9Y5M8 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SRPRBQ9Y5M8 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SRPRBQ9Y5M8 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SRPRBQ9Y5M8 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SRPRBQ9Y5M8 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SRPRBQ9Y5M8 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SRPRBQ9Y5M8 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SRPRBQ9Y5M8 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SRPRBQ9Y5M8 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SRPRBQ9Y5M8 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SRPRBQ9Y5M8 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SRPRBQ9Y5M8 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SRPRBQ9Y5M8 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SRPRBQ9Y5M8 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SRPRBQ9Y5M8 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SRPRBQ9Y5M8 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SRPRBQ9Y5M8 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SRPRBQ9Y5M8 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SRPRBQ9Y5M8 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SRPRBQ9Y5M8 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SRPRBQ9Y5M8 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SRPRBQ9Y5M8 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SRPRBQ9Y5M8 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SRPRBQ9Y5M8 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SRPRBQ9Y5M8 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SRPRBQ9Y5M8 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SRPRBQ9Y5M8 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SRPRBQ9Y5M8 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SRPRBQ9Y5M8 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SRPRBQ9Y5M8 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SRPRBQ9Y5M8 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SRPRBQ9Y5M8 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SRPRBQ9Y5M8 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SRPRBQ9Y5M8 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SRPRBQ9Y5M8 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SRPRBQ9Y5M8 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SRPRBQ9Y5M8 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SRPRBQ9Y5M8 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SRPRBQ9Y5M8 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SRPRBQ9Y5M8 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SRPRBQ9Y5M8 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SRPRBQ9Y5M8 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SRPRBQ9Y5M8 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SRPRBQ9Y5M8 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SRPRBQ9Y5M8 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SRPRBQ9Y5M8 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SRPRBQ9Y5M8 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SRPRBQ9Y5M8 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SRPRBQ9Y5M8 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SRPRBQ9Y5M8 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SRPRBQ9Y5M8 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SRPRBQ9Y5M8 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SRPRBQ9Y5M8 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SRPRBQ9Y5M8 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SRPRBQ9Y5M8 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SRPRBQ9Y5M8 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SRPRBQ9Y5M8 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SRPRBQ9Y5M8 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SRPRBQ9Y5M8 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SRPRBQ9Y5M8 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SRPRBQ9Y5M8 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SRPRBQ9Y5M8 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SRPRBQ9Y5M8 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SRPRBQ9Y5M8 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SRPRBQ9Y5M8 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SRPRBQ9Y5M8 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SRPRBQ9Y5M8 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SRPRBQ9Y5M8 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
SRPRBQ9Y5M8 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SRPRBQ9Y5M8 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SRPRBQ9Y5M8 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SRPRBQ9Y5M8 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SRPRBQ9Y5M8 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SRPRBQ9Y5M8 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
SRPRBQ9Y5M8 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SRPRBQ9Y5M8 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SRPRBQ9Y5M8 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SRPRBQ9Y5M8 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SRPRBQ9Y5M8 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SRPRBQ9Y5M8 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SRPRBQ9Y5M8 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SRPRBQ9Y5M8 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SRPRBQ9Y5M8 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms