Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5J7

TIMM9, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit Tim9, humanhuman

Predictions only

Length 89 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM9Q9Y5J7 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
TIMM9Q9Y5J7 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
TIMM9Q9Y5J7 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
TIMM9Q9Y5J7 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TIMM9Q9Y5J7 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TIMM9Q9Y5J7 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TIMM9Q9Y5J7 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TIMM9Q9Y5J7 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TIMM9Q9Y5J7 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TIMM9Q9Y5J7 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TIMM9Q9Y5J7 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TIMM9Q9Y5J7 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TIMM9Q9Y5J7 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TIMM9Q9Y5J7 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TIMM9Q9Y5J7 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TIMM9Q9Y5J7 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TIMM9Q9Y5J7 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TIMM9Q9Y5J7 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TIMM9Q9Y5J7 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
TIMM9Q9Y5J7 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
TIMM9Q9Y5J7 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
TIMM9Q9Y5J7 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
TIMM9Q9Y5J7 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TIMM9Q9Y5J7 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TIMM9Q9Y5J7 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TIMM9Q9Y5J7 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TIMM9Q9Y5J7 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TIMM9Q9Y5J7 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TIMM9Q9Y5J7 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
TIMM9Q9Y5J7 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TIMM9Q9Y5J7 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TIMM9Q9Y5J7 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TIMM9Q9Y5J7 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TIMM9Q9Y5J7 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TIMM9Q9Y5J7 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TIMM9Q9Y5J7 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TIMM9Q9Y5J7 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TIMM9Q9Y5J7 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TIMM9Q9Y5J7 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TIMM9Q9Y5J7 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TIMM9Q9Y5J7 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TIMM9Q9Y5J7 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TIMM9Q9Y5J7 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TIMM9Q9Y5J7 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TIMM9Q9Y5J7 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TIMM9Q9Y5J7 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TIMM9Q9Y5J7 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TIMM9Q9Y5J7 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TIMM9Q9Y5J7 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TIMM9Q9Y5J7 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TIMM9Q9Y5J7 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TIMM9Q9Y5J7 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TIMM9Q9Y5J7 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TIMM9Q9Y5J7 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TIMM9Q9Y5J7 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TIMM9Q9Y5J7 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TIMM9Q9Y5J7 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TIMM9Q9Y5J7 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TIMM9Q9Y5J7 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TIMM9Q9Y5J7 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TIMM9Q9Y5J7 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TIMM9Q9Y5J7 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TIMM9Q9Y5J7 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TIMM9Q9Y5J7 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TIMM9Q9Y5J7 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TIMM9Q9Y5J7 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TIMM9Q9Y5J7 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TIMM9Q9Y5J7 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TIMM9Q9Y5J7 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TIMM9Q9Y5J7 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TIMM9Q9Y5J7 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TIMM9Q9Y5J7 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TIMM9Q9Y5J7 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TIMM9Q9Y5J7 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TIMM9Q9Y5J7 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TIMM9Q9Y5J7 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TIMM9Q9Y5J7 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TIMM9Q9Y5J7 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TIMM9Q9Y5J7 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TIMM9Q9Y5J7 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TIMM9Q9Y5J7 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TIMM9Q9Y5J7 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TIMM9Q9Y5J7 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TIMM9Q9Y5J7 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TIMM9Q9Y5J7 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TIMM9Q9Y5J7 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TIMM9Q9Y5J7 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TIMM9Q9Y5J7 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TIMM9Q9Y5J7 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TIMM9Q9Y5J7 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TIMM9Q9Y5J7 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TIMM9Q9Y5J7 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TIMM9Q9Y5J7 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TIMM9Q9Y5J7 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TIMM9Q9Y5J7 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
TIMM9Q9Y5J7 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TIMM9Q9Y5J7 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TIMM9Q9Y5J7 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TIMM9Q9Y5J7 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TIMM9Q9Y5J7 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms