Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5B9

SUPT16H, FACT complex subunit SPT16, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,047 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUPT16HQ9Y5B9 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SUPT16HQ9Y5B9 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SUPT16HQ9Y5B9 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SUPT16HQ9Y5B9 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SUPT16HQ9Y5B9 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SUPT16HQ9Y5B9 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SUPT16HQ9Y5B9 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SUPT16HQ9Y5B9 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SUPT16HQ9Y5B9 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SUPT16HQ9Y5B9 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SUPT16HQ9Y5B9 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SUPT16HQ9Y5B9 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SUPT16HQ9Y5B9 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SUPT16HQ9Y5B9 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SUPT16HQ9Y5B9 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SUPT16HQ9Y5B9 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SUPT16HQ9Y5B9 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SUPT16HQ9Y5B9 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SUPT16HQ9Y5B9 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SUPT16HQ9Y5B9 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SUPT16HQ9Y5B9 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SUPT16HQ9Y5B9 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SUPT16HQ9Y5B9 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SUPT16HQ9Y5B9 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
SUPT16HQ9Y5B9 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SUPT16HQ9Y5B9 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SUPT16HQ9Y5B9 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SUPT16HQ9Y5B9 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SUPT16HQ9Y5B9 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SUPT16HQ9Y5B9 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SUPT16HQ9Y5B9 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SUPT16HQ9Y5B9 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SUPT16HQ9Y5B9 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SUPT16HQ9Y5B9 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SUPT16HQ9Y5B9 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SUPT16HQ9Y5B9 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SUPT16HQ9Y5B9 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SUPT16HQ9Y5B9 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SUPT16HQ9Y5B9 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SUPT16HQ9Y5B9 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SUPT16HQ9Y5B9 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SUPT16HQ9Y5B9 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SUPT16HQ9Y5B9 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SUPT16HQ9Y5B9 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SUPT16HQ9Y5B9 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SUPT16HQ9Y5B9 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SUPT16HQ9Y5B9 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SUPT16HQ9Y5B9 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SUPT16HQ9Y5B9 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SUPT16HQ9Y5B9 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SUPT16HQ9Y5B9 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SUPT16HQ9Y5B9 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SUPT16HQ9Y5B9 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SUPT16HQ9Y5B9 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SUPT16HQ9Y5B9 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SUPT16HQ9Y5B9 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
SUPT16HQ9Y5B9 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
SUPT16HQ9Y5B9 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
SUPT16HQ9Y5B9 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
SUPT16HQ9Y5B9 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SUPT16HQ9Y5B9 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SUPT16HQ9Y5B9 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SUPT16HQ9Y5B9 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SUPT16HQ9Y5B9 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
SUPT16HQ9Y5B9 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SUPT16HQ9Y5B9 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SUPT16HQ9Y5B9 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SUPT16HQ9Y5B9 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SUPT16HQ9Y5B9 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SUPT16HQ9Y5B9 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SUPT16HQ9Y5B9 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SUPT16HQ9Y5B9 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SUPT16HQ9Y5B9 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
SUPT16HQ9Y5B9 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SUPT16HQ9Y5B9 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SUPT16HQ9Y5B9 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SUPT16HQ9Y5B9 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SUPT16HQ9Y5B9 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SUPT16HQ9Y5B9 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SUPT16HQ9Y5B9 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SUPT16HQ9Y5B9 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SUPT16HQ9Y5B9 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SUPT16HQ9Y5B9 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SUPT16HQ9Y5B9 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SUPT16HQ9Y5B9 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SUPT16HQ9Y5B9 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
SUPT16HQ9Y5B9 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SUPT16HQ9Y5B9 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
SUPT16HQ9Y5B9 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SUPT16HQ9Y5B9 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SUPT16HQ9Y5B9 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SUPT16HQ9Y5B9 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SUPT16HQ9Y5B9 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SUPT16HQ9Y5B9 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SUPT16HQ9Y5B9 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SUPT16HQ9Y5B9 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SUPT16HQ9Y5B9 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SUPT16HQ9Y5B9 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SUPT16HQ9Y5B9 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SUPT16HQ9Y5B9 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms