Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3E1

HDGFL3, Hepatoma-derived growth factor-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDGFL3Q9Y3E1 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
HDGFL3Q9Y3E1 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HDGFL3Q9Y3E1 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HDGFL3Q9Y3E1 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HDGFL3Q9Y3E1 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HDGFL3Q9Y3E1 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HDGFL3Q9Y3E1 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HDGFL3Q9Y3E1 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HDGFL3Q9Y3E1 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HDGFL3Q9Y3E1 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
HDGFL3Q9Y3E1 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HDGFL3Q9Y3E1 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HDGFL3Q9Y3E1 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HDGFL3Q9Y3E1 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HDGFL3Q9Y3E1 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HDGFL3Q9Y3E1 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HDGFL3Q9Y3E1 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HDGFL3Q9Y3E1 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HDGFL3Q9Y3E1 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HDGFL3Q9Y3E1 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HDGFL3Q9Y3E1 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
HDGFL3Q9Y3E1 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
HDGFL3Q9Y3E1 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.57
HDGFL3Q9Y3E1 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
HDGFL3Q9Y3E1 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
HDGFL3Q9Y3E1 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
HDGFL3Q9Y3E1 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HDGFL3Q9Y3E1 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HDGFL3Q9Y3E1 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
HDGFL3Q9Y3E1 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HDGFL3Q9Y3E1 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HDGFL3Q9Y3E1 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HDGFL3Q9Y3E1 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HDGFL3Q9Y3E1 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HDGFL3Q9Y3E1 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HDGFL3Q9Y3E1 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HDGFL3Q9Y3E1 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HDGFL3Q9Y3E1 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HDGFL3Q9Y3E1 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
HDGFL3Q9Y3E1 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HDGFL3Q9Y3E1 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
HDGFL3Q9Y3E1 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
HDGFL3Q9Y3E1 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HDGFL3Q9Y3E1 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HDGFL3Q9Y3E1 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HDGFL3Q9Y3E1 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HDGFL3Q9Y3E1 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HDGFL3Q9Y3E1 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HDGFL3Q9Y3E1 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HDGFL3Q9Y3E1 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HDGFL3Q9Y3E1 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HDGFL3Q9Y3E1 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HDGFL3Q9Y3E1 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HDGFL3Q9Y3E1 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HDGFL3Q9Y3E1 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HDGFL3Q9Y3E1 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HDGFL3Q9Y3E1 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HDGFL3Q9Y3E1 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HDGFL3Q9Y3E1 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HDGFL3Q9Y3E1 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HDGFL3Q9Y3E1 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
HDGFL3Q9Y3E1 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HDGFL3Q9Y3E1 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HDGFL3Q9Y3E1 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HDGFL3Q9Y3E1 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
HDGFL3Q9Y3E1 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HDGFL3Q9Y3E1 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
HDGFL3Q9Y3E1 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HDGFL3Q9Y3E1 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HDGFL3Q9Y3E1 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HDGFL3Q9Y3E1 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HDGFL3Q9Y3E1 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HDGFL3Q9Y3E1 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HDGFL3Q9Y3E1 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HDGFL3Q9Y3E1 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HDGFL3Q9Y3E1 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HDGFL3Q9Y3E1 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HDGFL3Q9Y3E1 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HDGFL3Q9Y3E1 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HDGFL3Q9Y3E1 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HDGFL3Q9Y3E1 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HDGFL3Q9Y3E1 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HDGFL3Q9Y3E1 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HDGFL3Q9Y3E1 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HDGFL3Q9Y3E1 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
HDGFL3Q9Y3E1 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HDGFL3Q9Y3E1 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HDGFL3Q9Y3E1 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HDGFL3Q9Y3E1 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HDGFL3Q9Y3E1 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HDGFL3Q9Y3E1 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HDGFL3Q9Y3E1 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HDGFL3Q9Y3E1 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HDGFL3Q9Y3E1 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HDGFL3Q9Y3E1 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HDGFL3Q9Y3E1 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HDGFL3Q9Y3E1 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HDGFL3Q9Y3E1 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HDGFL3Q9Y3E1 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HDGFL3Q9Y3E1 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms