Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3B1

PRELID3B, PRELI domain containing protein 3B, humanhuman

Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRELID3BQ9Y3B1 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PRELID3BQ9Y3B1 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PRELID3BQ9Y3B1 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PRELID3BQ9Y3B1 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PRELID3BQ9Y3B1 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PRELID3BQ9Y3B1 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PRELID3BQ9Y3B1 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PRELID3BQ9Y3B1 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PRELID3BQ9Y3B1 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PRELID3BQ9Y3B1 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PRELID3BQ9Y3B1 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PRELID3BQ9Y3B1 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PRELID3BQ9Y3B1 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PRELID3BQ9Y3B1 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PRELID3BQ9Y3B1 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PRELID3BQ9Y3B1 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PRELID3BQ9Y3B1 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PRELID3BQ9Y3B1 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PRELID3BQ9Y3B1 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PRELID3BQ9Y3B1 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PRELID3BQ9Y3B1 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PRELID3BQ9Y3B1 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PRELID3BQ9Y3B1 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PRELID3BQ9Y3B1 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PRELID3BQ9Y3B1 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PRELID3BQ9Y3B1 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PRELID3BQ9Y3B1 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PRELID3BQ9Y3B1 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PRELID3BQ9Y3B1 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PRELID3BQ9Y3B1 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PRELID3BQ9Y3B1 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PRELID3BQ9Y3B1 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PRELID3BQ9Y3B1 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PRELID3BQ9Y3B1 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PRELID3BQ9Y3B1 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PRELID3BQ9Y3B1 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PRELID3BQ9Y3B1 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PRELID3BQ9Y3B1 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PRELID3BQ9Y3B1 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PRELID3BQ9Y3B1 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
PRELID3BQ9Y3B1 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PRELID3BQ9Y3B1 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PRELID3BQ9Y3B1 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PRELID3BQ9Y3B1 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PRELID3BQ9Y3B1 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PRELID3BQ9Y3B1 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PRELID3BQ9Y3B1 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PRELID3BQ9Y3B1 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PRELID3BQ9Y3B1 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PRELID3BQ9Y3B1 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PRELID3BQ9Y3B1 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PRELID3BQ9Y3B1 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PRELID3BQ9Y3B1 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PRELID3BQ9Y3B1 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PRELID3BQ9Y3B1 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PRELID3BQ9Y3B1 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PRELID3BQ9Y3B1 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PRELID3BQ9Y3B1 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PRELID3BQ9Y3B1 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PRELID3BQ9Y3B1 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PRELID3BQ9Y3B1 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PRELID3BQ9Y3B1 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PRELID3BQ9Y3B1 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PRELID3BQ9Y3B1 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PRELID3BQ9Y3B1 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PRELID3BQ9Y3B1 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PRELID3BQ9Y3B1 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PRELID3BQ9Y3B1 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
PRELID3BQ9Y3B1 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PRELID3BQ9Y3B1 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PRELID3BQ9Y3B1 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PRELID3BQ9Y3B1 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PRELID3BQ9Y3B1 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PRELID3BQ9Y3B1 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
PRELID3BQ9Y3B1 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PRELID3BQ9Y3B1 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PRELID3BQ9Y3B1 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PRELID3BQ9Y3B1 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PRELID3BQ9Y3B1 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PRELID3BQ9Y3B1 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PRELID3BQ9Y3B1 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PRELID3BQ9Y3B1 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PRELID3BQ9Y3B1 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PRELID3BQ9Y3B1 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PRELID3BQ9Y3B1 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PRELID3BQ9Y3B1 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PRELID3BQ9Y3B1 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PRELID3BQ9Y3B1 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PRELID3BQ9Y3B1 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PRELID3BQ9Y3B1 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PRELID3BQ9Y3B1 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PRELID3BQ9Y3B1 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PRELID3BQ9Y3B1 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PRELID3BQ9Y3B1 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PRELID3BQ9Y3B1 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PRELID3BQ9Y3B1 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PRELID3BQ9Y3B1 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PRELID3BQ9Y3B1 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PRELID3BQ9Y3B1 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PRELID3BQ9Y3B1 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms