Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2S0

POLR1D, DNA-directed RNA polymerases I and III subunit RPAC2, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1DQ9Y2S0 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
POLR1DQ9Y2S0 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
POLR1DQ9Y2S0 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
POLR1DQ9Y2S0 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
POLR1DQ9Y2S0 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
POLR1DQ9Y2S0 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
POLR1DQ9Y2S0 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
POLR1DQ9Y2S0 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
POLR1DQ9Y2S0 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
POLR1DQ9Y2S0 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
POLR1DQ9Y2S0 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
POLR1DQ9Y2S0 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
POLR1DQ9Y2S0 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
POLR1DQ9Y2S0 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
POLR1DQ9Y2S0 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
POLR1DQ9Y2S0 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
POLR1DQ9Y2S0 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
POLR1DQ9Y2S0 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
POLR1DQ9Y2S0 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
POLR1DQ9Y2S0 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
POLR1DQ9Y2S0 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
POLR1DQ9Y2S0 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
POLR1DQ9Y2S0 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
POLR1DQ9Y2S0 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
POLR1DQ9Y2S0 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
POLR1DQ9Y2S0 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
POLR1DQ9Y2S0 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
POLR1DQ9Y2S0 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
POLR1DQ9Y2S0 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
POLR1DQ9Y2S0 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
POLR1DQ9Y2S0 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
POLR1DQ9Y2S0 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
POLR1DQ9Y2S0 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
POLR1DQ9Y2S0 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
POLR1DQ9Y2S0 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
POLR1DQ9Y2S0 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
POLR1DQ9Y2S0 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
POLR1DQ9Y2S0 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
POLR1DQ9Y2S0 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
POLR1DQ9Y2S0 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
POLR1DQ9Y2S0 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
POLR1DQ9Y2S0 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
POLR1DQ9Y2S0 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
POLR1DQ9Y2S0 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
POLR1DQ9Y2S0 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
POLR1DQ9Y2S0 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
POLR1DQ9Y2S0 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
POLR1DQ9Y2S0 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
POLR1DQ9Y2S0 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
POLR1DQ9Y2S0 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
POLR1DQ9Y2S0 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
POLR1DQ9Y2S0 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
POLR1DQ9Y2S0 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
POLR1DQ9Y2S0 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
POLR1DQ9Y2S0 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
POLR1DQ9Y2S0 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
POLR1DQ9Y2S0 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
POLR1DQ9Y2S0 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
POLR1DQ9Y2S0 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
POLR1DQ9Y2S0 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
POLR1DQ9Y2S0 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
POLR1DQ9Y2S0 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
POLR1DQ9Y2S0 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
POLR1DQ9Y2S0 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
POLR1DQ9Y2S0 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
POLR1DQ9Y2S0 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
POLR1DQ9Y2S0 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
POLR1DQ9Y2S0 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
POLR1DQ9Y2S0 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
POLR1DQ9Y2S0 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
POLR1DQ9Y2S0 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
POLR1DQ9Y2S0 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
POLR1DQ9Y2S0 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
POLR1DQ9Y2S0 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
POLR1DQ9Y2S0 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
POLR1DQ9Y2S0 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
POLR1DQ9Y2S0 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
POLR1DQ9Y2S0 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
POLR1DQ9Y2S0 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
POLR1DQ9Y2S0 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
POLR1DQ9Y2S0 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
POLR1DQ9Y2S0 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
POLR1DQ9Y2S0 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
POLR1DQ9Y2S0 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
POLR1DQ9Y2S0 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
POLR1DQ9Y2S0 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
POLR1DQ9Y2S0 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
POLR1DQ9Y2S0 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
POLR1DQ9Y2S0 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
POLR1DQ9Y2S0 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
POLR1DQ9Y2S0 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
POLR1DQ9Y2S0 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
POLR1DQ9Y2S0 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
POLR1DQ9Y2S0 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
POLR1DQ9Y2S0 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
POLR1DQ9Y2S0 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
POLR1DQ9Y2S0 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
POLR1DQ9Y2S0 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
POLR1DQ9Y2S0 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
POLR1DQ9Y2S0 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms