Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y215

COLQ, Acetylcholinesterase collagenic tail peptide, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COLQQ9Y215 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
COLQQ9Y215 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
COLQQ9Y215 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
COLQQ9Y215 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
COLQQ9Y215 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
COLQQ9Y215 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
COLQQ9Y215 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
COLQQ9Y215 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
COLQQ9Y215 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
COLQQ9Y215 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
COLQQ9Y215 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
COLQQ9Y215 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
COLQQ9Y215 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
COLQQ9Y215 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
COLQQ9Y215 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
COLQQ9Y215 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
COLQQ9Y215 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
COLQQ9Y215 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
COLQQ9Y215 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
COLQQ9Y215 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
COLQQ9Y215 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
COLQQ9Y215 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
COLQQ9Y215 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
COLQQ9Y215 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
COLQQ9Y215 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
COLQQ9Y215 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
COLQQ9Y215 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
COLQQ9Y215 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
COLQQ9Y215 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
COLQQ9Y215 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
COLQQ9Y215 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
COLQQ9Y215 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
COLQQ9Y215 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
COLQQ9Y215 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
COLQQ9Y215 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
COLQQ9Y215 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
COLQQ9Y215 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
COLQQ9Y215 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
COLQQ9Y215 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
COLQQ9Y215 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
COLQQ9Y215 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
COLQQ9Y215 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
COLQQ9Y215 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
COLQQ9Y215 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
COLQQ9Y215 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
COLQQ9Y215 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
COLQQ9Y215 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
COLQQ9Y215 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
COLQQ9Y215 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
COLQQ9Y215 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
COLQQ9Y215 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
COLQQ9Y215 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
COLQQ9Y215 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
COLQQ9Y215 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
COLQQ9Y215 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
COLQQ9Y215 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
COLQQ9Y215 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
COLQQ9Y215 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
COLQQ9Y215 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
COLQQ9Y215 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
COLQQ9Y215 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
COLQQ9Y215 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
COLQQ9Y215 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
COLQQ9Y215 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
COLQQ9Y215 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
COLQQ9Y215 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
COLQQ9Y215 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
COLQQ9Y215 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
COLQQ9Y215 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
COLQQ9Y215 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
COLQQ9Y215 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
COLQQ9Y215 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
COLQQ9Y215 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
COLQQ9Y215 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
COLQQ9Y215 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
COLQQ9Y215 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
COLQQ9Y215 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
COLQQ9Y215 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
COLQQ9Y215 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
COLQQ9Y215 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
COLQQ9Y215 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
COLQQ9Y215 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
COLQQ9Y215 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
COLQQ9Y215 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
COLQQ9Y215 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
COLQQ9Y215 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
COLQQ9Y215 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
COLQQ9Y215 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
COLQQ9Y215 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
COLQQ9Y215 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
COLQQ9Y215 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
COLQQ9Y215 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
COLQQ9Y215 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
COLQQ9Y215 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
COLQQ9Y215 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
COLQQ9Y215 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
COLQQ9Y215 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
COLQQ9Y215 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
COLQQ9Y215 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
COLQQ9Y215 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms