Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQE7

SMC3, Structural maintenance of chromosomes protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC3Q9UQE7 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SMC3Q9UQE7 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SMC3Q9UQE7 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SMC3Q9UQE7 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
SMC3Q9UQE7 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SMC3Q9UQE7 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
SMC3Q9UQE7 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SMC3Q9UQE7 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SMC3Q9UQE7 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SMC3Q9UQE7 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SMC3Q9UQE7 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SMC3Q9UQE7 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SMC3Q9UQE7 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SMC3Q9UQE7 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SMC3Q9UQE7 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SMC3Q9UQE7 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SMC3Q9UQE7 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SMC3Q9UQE7 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SMC3Q9UQE7 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SMC3Q9UQE7 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SMC3Q9UQE7 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SMC3Q9UQE7 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SMC3Q9UQE7 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SMC3Q9UQE7 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SMC3Q9UQE7 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SMC3Q9UQE7 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SMC3Q9UQE7 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
SMC3Q9UQE7 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SMC3Q9UQE7 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SMC3Q9UQE7 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SMC3Q9UQE7 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SMC3Q9UQE7 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SMC3Q9UQE7 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SMC3Q9UQE7 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SMC3Q9UQE7 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SMC3Q9UQE7 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SMC3Q9UQE7 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SMC3Q9UQE7 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SMC3Q9UQE7 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SMC3Q9UQE7 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SMC3Q9UQE7 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SMC3Q9UQE7 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SMC3Q9UQE7 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SMC3Q9UQE7 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SMC3Q9UQE7 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
SMC3Q9UQE7 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SMC3Q9UQE7 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SMC3Q9UQE7 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SMC3Q9UQE7 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SMC3Q9UQE7 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SMC3Q9UQE7 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SMC3Q9UQE7 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SMC3Q9UQE7 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SMC3Q9UQE7 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SMC3Q9UQE7 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SMC3Q9UQE7 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SMC3Q9UQE7 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SMC3Q9UQE7 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SMC3Q9UQE7 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SMC3Q9UQE7 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
SMC3Q9UQE7 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SMC3Q9UQE7 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SMC3Q9UQE7 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SMC3Q9UQE7 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
SMC3Q9UQE7 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
SMC3Q9UQE7 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
SMC3Q9UQE7 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
SMC3Q9UQE7 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SMC3Q9UQE7 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SMC3Q9UQE7 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SMC3Q9UQE7 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SMC3Q9UQE7 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SMC3Q9UQE7 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
SMC3Q9UQE7 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SMC3Q9UQE7 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SMC3Q9UQE7 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
SMC3Q9UQE7 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SMC3Q9UQE7 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SMC3Q9UQE7 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SMC3Q9UQE7 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SMC3Q9UQE7 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SMC3Q9UQE7 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SMC3Q9UQE7 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SMC3Q9UQE7 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SMC3Q9UQE7 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SMC3Q9UQE7 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SMC3Q9UQE7 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SMC3Q9UQE7 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SMC3Q9UQE7 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
SMC3Q9UQE7 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SMC3Q9UQE7 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SMC3Q9UQE7 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SMC3Q9UQE7 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SMC3Q9UQE7 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SMC3Q9UQE7 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SMC3Q9UQE7 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SMC3Q9UQE7 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SMC3Q9UQE7 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SMC3Q9UQE7 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SMC3Q9UQE7 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms