Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPV9

TRAK1, Trafficking kinesin-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAK1Q9UPV9 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
TRAK1Q9UPV9 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
TRAK1Q9UPV9 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
TRAK1Q9UPV9 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
TRAK1Q9UPV9 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
TRAK1Q9UPV9 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
TRAK1Q9UPV9 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
TRAK1Q9UPV9 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
TRAK1Q9UPV9 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
TRAK1Q9UPV9 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
TRAK1Q9UPV9 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
TRAK1Q9UPV9 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
TRAK1Q9UPV9 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC29.06■■■□□ 2.24
TRAK1Q9UPV9 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
TRAK1Q9UPV9 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
TRAK1Q9UPV9 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
TRAK1Q9UPV9 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
TRAK1Q9UPV9 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
TRAK1Q9UPV9 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
TRAK1Q9UPV9 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
TRAK1Q9UPV9 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
TRAK1Q9UPV9 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
TRAK1Q9UPV9 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC29.05■■■□□ 2.24
TRAK1Q9UPV9 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
TRAK1Q9UPV9 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC29.05■■■□□ 2.24
TRAK1Q9UPV9 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
TRAK1Q9UPV9 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
TRAK1Q9UPV9 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
TRAK1Q9UPV9 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
TRAK1Q9UPV9 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
TRAK1Q9UPV9 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
TRAK1Q9UPV9 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
TRAK1Q9UPV9 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
TRAK1Q9UPV9 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
TRAK1Q9UPV9 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
TRAK1Q9UPV9 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
TRAK1Q9UPV9 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
TRAK1Q9UPV9 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
TRAK1Q9UPV9 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
TRAK1Q9UPV9 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC29.04■■■□□ 2.24
TRAK1Q9UPV9 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
TRAK1Q9UPV9 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
TRAK1Q9UPV9 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
TRAK1Q9UPV9 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
TRAK1Q9UPV9 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
TRAK1Q9UPV9 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
TRAK1Q9UPV9 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
TRAK1Q9UPV9 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
TRAK1Q9UPV9 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
TRAK1Q9UPV9 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
TRAK1Q9UPV9 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
TRAK1Q9UPV9 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
TRAK1Q9UPV9 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
TRAK1Q9UPV9 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
TRAK1Q9UPV9 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC29.03■■■□□ 2.24
TRAK1Q9UPV9 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
TRAK1Q9UPV9 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
TRAK1Q9UPV9 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
TRAK1Q9UPV9 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
TRAK1Q9UPV9 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
TRAK1Q9UPV9 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
TRAK1Q9UPV9 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
TRAK1Q9UPV9 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
TRAK1Q9UPV9 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
TRAK1Q9UPV9 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
TRAK1Q9UPV9 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
TRAK1Q9UPV9 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
TRAK1Q9UPV9 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
TRAK1Q9UPV9 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
TRAK1Q9UPV9 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
TRAK1Q9UPV9 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
TRAK1Q9UPV9 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
TRAK1Q9UPV9 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
TRAK1Q9UPV9 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
TRAK1Q9UPV9 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
TRAK1Q9UPV9 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
TRAK1Q9UPV9 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
TRAK1Q9UPV9 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
TRAK1Q9UPV9 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
TRAK1Q9UPV9 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
TRAK1Q9UPV9 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
TRAK1Q9UPV9 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
TRAK1Q9UPV9 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
TRAK1Q9UPV9 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
TRAK1Q9UPV9 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
TRAK1Q9UPV9 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
TRAK1Q9UPV9 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
TRAK1Q9UPV9 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
TRAK1Q9UPV9 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
TRAK1Q9UPV9 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
TRAK1Q9UPV9 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
TRAK1Q9UPV9 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
TRAK1Q9UPV9 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
TRAK1Q9UPV9 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
TRAK1Q9UPV9 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
TRAK1Q9UPV9 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
TRAK1Q9UPV9 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC29■■■□□ 2.23
TRAK1Q9UPV9 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
TRAK1Q9UPV9 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
TRAK1Q9UPV9 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms