Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL52

TMPRSS11E, Transmembrane protease serine 11E, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPRSS11EQ9UL52 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMPRSS11EQ9UL52 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMPRSS11EQ9UL52 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMPRSS11EQ9UL52 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMPRSS11EQ9UL52 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMPRSS11EQ9UL52 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMPRSS11EQ9UL52 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMPRSS11EQ9UL52 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMPRSS11EQ9UL52 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMPRSS11EQ9UL52 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
TMPRSS11EQ9UL52 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMPRSS11EQ9UL52 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMPRSS11EQ9UL52 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMPRSS11EQ9UL52 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMPRSS11EQ9UL52 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMPRSS11EQ9UL52 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMPRSS11EQ9UL52 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMPRSS11EQ9UL52 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMPRSS11EQ9UL52 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMPRSS11EQ9UL52 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMPRSS11EQ9UL52 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMPRSS11EQ9UL52 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMPRSS11EQ9UL52 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMPRSS11EQ9UL52 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMPRSS11EQ9UL52 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMPRSS11EQ9UL52 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMPRSS11EQ9UL52 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMPRSS11EQ9UL52 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMPRSS11EQ9UL52 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMPRSS11EQ9UL52 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMPRSS11EQ9UL52 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMPRSS11EQ9UL52 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMPRSS11EQ9UL52 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMPRSS11EQ9UL52 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMPRSS11EQ9UL52 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMPRSS11EQ9UL52 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
TMPRSS11EQ9UL52 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMPRSS11EQ9UL52 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMPRSS11EQ9UL52 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMPRSS11EQ9UL52 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMPRSS11EQ9UL52 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMPRSS11EQ9UL52 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMPRSS11EQ9UL52 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMPRSS11EQ9UL52 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMPRSS11EQ9UL52 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMPRSS11EQ9UL52 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMPRSS11EQ9UL52 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMPRSS11EQ9UL52 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMPRSS11EQ9UL52 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMPRSS11EQ9UL52 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMPRSS11EQ9UL52 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
TMPRSS11EQ9UL52 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMPRSS11EQ9UL52 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMPRSS11EQ9UL52 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMPRSS11EQ9UL52 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMPRSS11EQ9UL52 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMPRSS11EQ9UL52 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
TMPRSS11EQ9UL52 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMPRSS11EQ9UL52 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMPRSS11EQ9UL52 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMPRSS11EQ9UL52 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
TMPRSS11EQ9UL52 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMPRSS11EQ9UL52 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMPRSS11EQ9UL52 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMPRSS11EQ9UL52 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMPRSS11EQ9UL52 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMPRSS11EQ9UL52 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMPRSS11EQ9UL52 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMPRSS11EQ9UL52 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TMPRSS11EQ9UL52 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TMPRSS11EQ9UL52 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TMPRSS11EQ9UL52 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
TMPRSS11EQ9UL52 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TMPRSS11EQ9UL52 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TMPRSS11EQ9UL52 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TMPRSS11EQ9UL52 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TMPRSS11EQ9UL52 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
TMPRSS11EQ9UL52 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TMPRSS11EQ9UL52 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
TMPRSS11EQ9UL52 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TMPRSS11EQ9UL52 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
TMPRSS11EQ9UL52 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TMPRSS11EQ9UL52 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TMPRSS11EQ9UL52 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TMPRSS11EQ9UL52 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TMPRSS11EQ9UL52 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TMPRSS11EQ9UL52 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
TMPRSS11EQ9UL52 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
TMPRSS11EQ9UL52 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TMPRSS11EQ9UL52 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TMPRSS11EQ9UL52 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TMPRSS11EQ9UL52 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TMPRSS11EQ9UL52 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TMPRSS11EQ9UL52 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TMPRSS11EQ9UL52 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TMPRSS11EQ9UL52 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TMPRSS11EQ9UL52 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TMPRSS11EQ9UL52 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TMPRSS11EQ9UL52 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TMPRSS11EQ9UL52 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms